Protein–RNA interactions for Protein: Q14108

SCARB2, Lysosome membrane protein 2, humanhuman

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Length 478 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCARB2Q14108 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SCARB2Q14108 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SCARB2Q14108 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SCARB2Q14108 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SCARB2Q14108 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SCARB2Q14108 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SCARB2Q14108 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SCARB2Q14108 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SCARB2Q14108 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SCARB2Q14108 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SCARB2Q14108 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SCARB2Q14108 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SCARB2Q14108 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
SCARB2Q14108 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SCARB2Q14108 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SCARB2Q14108 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
SCARB2Q14108 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SCARB2Q14108 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
SCARB2Q14108 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SCARB2Q14108 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SCARB2Q14108 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
SCARB2Q14108 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SCARB2Q14108 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SCARB2Q14108 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
SCARB2Q14108 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
SCARB2Q14108 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
SCARB2Q14108 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
SCARB2Q14108 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
SCARB2Q14108 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
SCARB2Q14108 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
SCARB2Q14108 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SCARB2Q14108 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SCARB2Q14108 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SCARB2Q14108 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
SCARB2Q14108 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SCARB2Q14108 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SCARB2Q14108 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
SCARB2Q14108 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SCARB2Q14108 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SCARB2Q14108 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
SCARB2Q14108 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
SCARB2Q14108 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
SCARB2Q14108 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
SCARB2Q14108 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
SCARB2Q14108 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
SCARB2Q14108 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
SCARB2Q14108 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
SCARB2Q14108 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
SCARB2Q14108 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
SCARB2Q14108 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
SCARB2Q14108 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
SCARB2Q14108 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
SCARB2Q14108 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
SCARB2Q14108 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
SCARB2Q14108 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
SCARB2Q14108 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
SCARB2Q14108 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
SCARB2Q14108 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
SCARB2Q14108 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
SCARB2Q14108 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC17.65■□□□□ 0.42
SCARB2Q14108 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
SCARB2Q14108 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
SCARB2Q14108 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
SCARB2Q14108 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
SCARB2Q14108 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
SCARB2Q14108 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
SCARB2Q14108 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
SCARB2Q14108 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
SCARB2Q14108 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
SCARB2Q14108 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
SCARB2Q14108 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
SCARB2Q14108 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
SCARB2Q14108 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
SCARB2Q14108 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
SCARB2Q14108 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
SCARB2Q14108 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
SCARB2Q14108 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.42
SCARB2Q14108 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
SCARB2Q14108 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
SCARB2Q14108 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
SCARB2Q14108 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
SCARB2Q14108 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
SCARB2Q14108 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
SCARB2Q14108 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
SCARB2Q14108 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
SCARB2Q14108 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
SCARB2Q14108 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
SCARB2Q14108 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
SCARB2Q14108 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
SCARB2Q14108 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
SCARB2Q14108 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
SCARB2Q14108 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
SCARB2Q14108 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
SCARB2Q14108 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
SCARB2Q14108 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
SCARB2Q14108 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC17.64■□□□□ 0.41
SCARB2Q14108 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
SCARB2Q14108 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
SCARB2Q14108 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
SCARB2Q14108 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
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