Protein–RNA interactions for Protein: Q13797

ITGA9, Integrin alpha-9, humanhuman

Predictions only

Length 1,035 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA9Q13797 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ITGA9Q13797 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
ITGA9Q13797 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ITGA9Q13797 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ITGA9Q13797 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ITGA9Q13797 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ITGA9Q13797 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
ITGA9Q13797 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ITGA9Q13797 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ITGA9Q13797 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
ITGA9Q13797 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ITGA9Q13797 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ITGA9Q13797 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
ITGA9Q13797 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ITGA9Q13797 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
ITGA9Q13797 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
ITGA9Q13797 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ITGA9Q13797 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC19.11■□□□□ 0.65
ITGA9Q13797 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ITGA9Q13797 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ITGA9Q13797 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
ITGA9Q13797 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
ITGA9Q13797 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
ITGA9Q13797 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ITGA9Q13797 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
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ITGA9Q13797 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
ITGA9Q13797 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
ITGA9Q13797 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC19.11■□□□□ 0.65
ITGA9Q13797 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ITGA9Q13797 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ITGA9Q13797 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ITGA9Q13797 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ITGA9Q13797 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
ITGA9Q13797 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC19.11■□□□□ 0.65
ITGA9Q13797 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ITGA9Q13797 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
ITGA9Q13797 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
ITGA9Q13797 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
ITGA9Q13797 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
ITGA9Q13797 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ITGA9Q13797 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
ITGA9Q13797 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
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ITGA9Q13797 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
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ITGA9Q13797 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ITGA9Q13797 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
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ITGA9Q13797 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ITGA9Q13797 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
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ITGA9Q13797 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
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ITGA9Q13797 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
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ITGA9Q13797 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ITGA9Q13797 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
ITGA9Q13797 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
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ITGA9Q13797 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
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ITGA9Q13797 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ITGA9Q13797 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ITGA9Q13797 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ITGA9Q13797 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ITGA9Q13797 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ITGA9Q13797 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ITGA9Q13797 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ITGA9Q13797 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
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ITGA9Q13797 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ITGA9Q13797 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ITGA9Q13797 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
ITGA9Q13797 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ITGA9Q13797 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ITGA9Q13797 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
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ITGA9Q13797 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ITGA9Q13797 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ITGA9Q13797 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ITGA9Q13797 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ITGA9Q13797 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ITGA9Q13797 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ITGA9Q13797 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
ITGA9Q13797 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
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