Protein–RNA interactions for Protein: Q13698

CACNA1S, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1S, humanhuman

Predictions only

Length 1,873 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA1SQ13698 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CACNA1SQ13698 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
CACNA1SQ13698 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CACNA1SQ13698 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CACNA1SQ13698 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CACNA1SQ13698 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CACNA1SQ13698 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CACNA1SQ13698 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CACNA1SQ13698 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CACNA1SQ13698 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CACNA1SQ13698 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CACNA1SQ13698 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CACNA1SQ13698 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CACNA1SQ13698 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CACNA1SQ13698 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
CACNA1SQ13698 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CACNA1SQ13698 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
CACNA1SQ13698 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CACNA1SQ13698 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CACNA1SQ13698 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CACNA1SQ13698 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CACNA1SQ13698 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CACNA1SQ13698 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CACNA1SQ13698 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CACNA1SQ13698 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CACNA1SQ13698 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CACNA1SQ13698 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CACNA1SQ13698 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CACNA1SQ13698 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CACNA1SQ13698 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
CACNA1SQ13698 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
CACNA1SQ13698 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CACNA1SQ13698 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
CACNA1SQ13698 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CACNA1SQ13698 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CACNA1SQ13698 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CACNA1SQ13698 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CACNA1SQ13698 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CACNA1SQ13698 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CACNA1SQ13698 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CACNA1SQ13698 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CACNA1SQ13698 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CACNA1SQ13698 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CACNA1SQ13698 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CACNA1SQ13698 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CACNA1SQ13698 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CACNA1SQ13698 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CACNA1SQ13698 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CACNA1SQ13698 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CACNA1SQ13698 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
CACNA1SQ13698 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CACNA1SQ13698 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CACNA1SQ13698 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CACNA1SQ13698 AC006538.3-201ENST00000612495 578 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
CACNA1SQ13698 MIR7706-201ENST00000613747 67 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
CACNA1SQ13698 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CACNA1SQ13698 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CACNA1SQ13698 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CACNA1SQ13698 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CACNA1SQ13698 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CACNA1SQ13698 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CACNA1SQ13698 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CACNA1SQ13698 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CACNA1SQ13698 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CACNA1SQ13698 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CACNA1SQ13698 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CACNA1SQ13698 AC139887.2-202ENST00000507446 534 ntTSL 4 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CACNA1SQ13698 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CACNA1SQ13698 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CACNA1SQ13698 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CACNA1SQ13698 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CACNA1SQ13698 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CACNA1SQ13698 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CACNA1SQ13698 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
CACNA1SQ13698 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CACNA1SQ13698 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CACNA1SQ13698 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CACNA1SQ13698 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CACNA1SQ13698 YWHAZ-204ENST00000395953 994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CACNA1SQ13698 AP001005.1-201ENST00000571755 1248 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
CACNA1SQ13698 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CACNA1SQ13698 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CACNA1SQ13698 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CACNA1SQ13698 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CACNA1SQ13698 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CACNA1SQ13698 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CACNA1SQ13698 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CACNA1SQ13698 FIGNL1-207ENST00000435566 593 ntTSL 4 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CACNA1SQ13698 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CACNA1SQ13698 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
CACNA1SQ13698 AL773604.1-201ENST00000617417 272 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
CACNA1SQ13698 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CACNA1SQ13698 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CACNA1SQ13698 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CACNA1SQ13698 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CACNA1SQ13698 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CACNA1SQ13698 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CACNA1SQ13698 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CACNA1SQ13698 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
CACNA1SQ13698 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
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