Protein–RNA interactions for Protein: Q13635

PTCH1, Protein patched homolog 1, humanhuman

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Length 1,447 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTCH1Q13635 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
PTCH1Q13635 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
PTCH1Q13635 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.15■■□□□ 1.78
PTCH1Q13635 AL512343.2-201ENST00000609423 490 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
PTCH1Q13635 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
PTCH1Q13635 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
PTCH1Q13635 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
PTCH1Q13635 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
PTCH1Q13635 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
PTCH1Q13635 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
PTCH1Q13635 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
PTCH1Q13635 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
PTCH1Q13635 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
PTCH1Q13635 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
PTCH1Q13635 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
PTCH1Q13635 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
PTCH1Q13635 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
PTCH1Q13635 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
PTCH1Q13635 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.78
PTCH1Q13635 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.78
PTCH1Q13635 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
PTCH1Q13635 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
PTCH1Q13635 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
PTCH1Q13635 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
PTCH1Q13635 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
PTCH1Q13635 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
PTCH1Q13635 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
PTCH1Q13635 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.77
PTCH1Q13635 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
PTCH1Q13635 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
PTCH1Q13635 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.77
PTCH1Q13635 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
PTCH1Q13635 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
PTCH1Q13635 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
PTCH1Q13635 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
PTCH1Q13635 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.77
PTCH1Q13635 FIGNL1-207ENST00000435566 593 ntTSL 4 BASIC26.14■■□□□ 1.77
PTCH1Q13635 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC26.14■■□□□ 1.77
PTCH1Q13635 GOLGA7-203ENST00000518270 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.77
PTCH1Q13635 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
PTCH1Q13635 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
PTCH1Q13635 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
PTCH1Q13635 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
PTCH1Q13635 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
PTCH1Q13635 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
PTCH1Q13635 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
PTCH1Q13635 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
PTCH1Q13635 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
PTCH1Q13635 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
PTCH1Q13635 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
PTCH1Q13635 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
PTCH1Q13635 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
PTCH1Q13635 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
PTCH1Q13635 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC26.13■■□□□ 1.77
PTCH1Q13635 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
PTCH1Q13635 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
PTCH1Q13635 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
PTCH1Q13635 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
PTCH1Q13635 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
PTCH1Q13635 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
PTCH1Q13635 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
PTCH1Q13635 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
PTCH1Q13635 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
PTCH1Q13635 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
PTCH1Q13635 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
PTCH1Q13635 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
PTCH1Q13635 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
PTCH1Q13635 CELA2A-201ENST00000359621 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
PTCH1Q13635 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
PTCH1Q13635 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
PTCH1Q13635 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
PTCH1Q13635 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC26.12■■□□□ 1.77
PTCH1Q13635 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
PTCH1Q13635 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
PTCH1Q13635 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC26.12■■□□□ 1.77
PTCH1Q13635 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
PTCH1Q13635 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
PTCH1Q13635 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
PTCH1Q13635 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
PTCH1Q13635 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
PTCH1Q13635 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
PTCH1Q13635 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
PTCH1Q13635 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
PTCH1Q13635 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
PTCH1Q13635 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
PTCH1Q13635 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
PTCH1Q13635 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
PTCH1Q13635 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
PTCH1Q13635 SYS1-202ENST00000372727 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
PTCH1Q13635 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
PTCH1Q13635 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
PTCH1Q13635 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
PTCH1Q13635 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
PTCH1Q13635 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
PTCH1Q13635 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
PTCH1Q13635 AC104532.1-201ENST00000588891 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.11■■□□□ 1.77
PTCH1Q13635 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
PTCH1Q13635 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
PTCH1Q13635 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
PTCH1Q13635 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
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