Protein–RNA interactions for Protein: Q13619

CUL4A, Cullin-4A, humanhuman

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Length 759 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL4AQ13619 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CUL4AQ13619 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CUL4AQ13619 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CUL4AQ13619 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CUL4AQ13619 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CUL4AQ13619 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CUL4AQ13619 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CUL4AQ13619 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CUL4AQ13619 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
CUL4AQ13619 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CUL4AQ13619 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CUL4AQ13619 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CUL4AQ13619 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CUL4AQ13619 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CUL4AQ13619 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CUL4AQ13619 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CUL4AQ13619 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CUL4AQ13619 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
CUL4AQ13619 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CUL4AQ13619 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CUL4AQ13619 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CUL4AQ13619 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CUL4AQ13619 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
CUL4AQ13619 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CUL4AQ13619 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
CUL4AQ13619 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CUL4AQ13619 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
CUL4AQ13619 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CUL4AQ13619 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CUL4AQ13619 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CUL4AQ13619 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CUL4AQ13619 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CUL4AQ13619 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CUL4AQ13619 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CUL4AQ13619 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CUL4AQ13619 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CUL4AQ13619 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CUL4AQ13619 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CUL4AQ13619 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CUL4AQ13619 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CUL4AQ13619 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CUL4AQ13619 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CUL4AQ13619 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CUL4AQ13619 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CUL4AQ13619 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CUL4AQ13619 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CUL4AQ13619 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CUL4AQ13619 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CUL4AQ13619 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CUL4AQ13619 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CUL4AQ13619 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CUL4AQ13619 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CUL4AQ13619 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CUL4AQ13619 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CUL4AQ13619 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CUL4AQ13619 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CUL4AQ13619 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CUL4AQ13619 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CUL4AQ13619 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CUL4AQ13619 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CUL4AQ13619 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CUL4AQ13619 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CUL4AQ13619 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CUL4AQ13619 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CUL4AQ13619 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CUL4AQ13619 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CUL4AQ13619 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CUL4AQ13619 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CUL4AQ13619 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CUL4AQ13619 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CUL4AQ13619 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CUL4AQ13619 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CUL4AQ13619 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CUL4AQ13619 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CUL4AQ13619 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CUL4AQ13619 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CUL4AQ13619 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CUL4AQ13619 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CUL4AQ13619 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CUL4AQ13619 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CUL4AQ13619 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CUL4AQ13619 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CUL4AQ13619 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CUL4AQ13619 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
CUL4AQ13619 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CUL4AQ13619 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CUL4AQ13619 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
CUL4AQ13619 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CUL4AQ13619 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
CUL4AQ13619 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CUL4AQ13619 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CUL4AQ13619 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CUL4AQ13619 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CUL4AQ13619 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CUL4AQ13619 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CUL4AQ13619 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CUL4AQ13619 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CUL4AQ13619 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CUL4AQ13619 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CUL4AQ13619 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
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