Protein–RNA interactions for Protein: Q13547

HDAC1, Histone deacetylase 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 482 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC1Q13547 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
HDAC1Q13547 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
HDAC1Q13547 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
HDAC1Q13547 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
HDAC1Q13547 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
HDAC1Q13547 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
HDAC1Q13547 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
HDAC1Q13547 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
HDAC1Q13547 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
HDAC1Q13547 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
HDAC1Q13547 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
HDAC1Q13547 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
HDAC1Q13547 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
HDAC1Q13547 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
HDAC1Q13547 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
HDAC1Q13547 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
HDAC1Q13547 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
HDAC1Q13547 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
HDAC1Q13547 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
HDAC1Q13547 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
HDAC1Q13547 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
HDAC1Q13547 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
HDAC1Q13547 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
HDAC1Q13547 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
HDAC1Q13547 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
HDAC1Q13547 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
HDAC1Q13547 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
HDAC1Q13547 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
HDAC1Q13547 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
HDAC1Q13547 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
HDAC1Q13547 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
HDAC1Q13547 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
HDAC1Q13547 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
HDAC1Q13547 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
HDAC1Q13547 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
HDAC1Q13547 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
HDAC1Q13547 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
HDAC1Q13547 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
HDAC1Q13547 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
HDAC1Q13547 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
HDAC1Q13547 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
HDAC1Q13547 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
HDAC1Q13547 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
HDAC1Q13547 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
HDAC1Q13547 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
HDAC1Q13547 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
HDAC1Q13547 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
HDAC1Q13547 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
HDAC1Q13547 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
HDAC1Q13547 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC23.44■■□□□ 1.34
HDAC1Q13547 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
HDAC1Q13547 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
HDAC1Q13547 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
HDAC1Q13547 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
HDAC1Q13547 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
HDAC1Q13547 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
HDAC1Q13547 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
HDAC1Q13547 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
HDAC1Q13547 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
HDAC1Q13547 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
HDAC1Q13547 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
HDAC1Q13547 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
HDAC1Q13547 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
HDAC1Q13547 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
HDAC1Q13547 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
HDAC1Q13547 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
HDAC1Q13547 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
HDAC1Q13547 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
HDAC1Q13547 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
HDAC1Q13547 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
HDAC1Q13547 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
HDAC1Q13547 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
HDAC1Q13547 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
HDAC1Q13547 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
HDAC1Q13547 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
HDAC1Q13547 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
HDAC1Q13547 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
HDAC1Q13547 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
HDAC1Q13547 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.43■■□□□ 1.34
HDAC1Q13547 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
HDAC1Q13547 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
HDAC1Q13547 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
HDAC1Q13547 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
HDAC1Q13547 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
HDAC1Q13547 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
HDAC1Q13547 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
HDAC1Q13547 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
HDAC1Q13547 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
HDAC1Q13547 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
HDAC1Q13547 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
HDAC1Q13547 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
HDAC1Q13547 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
HDAC1Q13547 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
HDAC1Q13547 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
HDAC1Q13547 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
HDAC1Q13547 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
HDAC1Q13547 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
HDAC1Q13547 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
HDAC1Q13547 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
HDAC1Q13547 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
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