Protein–RNA interactions for Protein: Q13033

STRN3, Striatin-3, humanhuman

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Length 797 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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STRN3Q13033 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
STRN3Q13033 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
STRN3Q13033 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
STRN3Q13033 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
STRN3Q13033 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
STRN3Q13033 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
STRN3Q13033 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
STRN3Q13033 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
STRN3Q13033 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
STRN3Q13033 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
STRN3Q13033 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
STRN3Q13033 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
STRN3Q13033 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
STRN3Q13033 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
STRN3Q13033 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
STRN3Q13033 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
STRN3Q13033 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
STRN3Q13033 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
STRN3Q13033 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
STRN3Q13033 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
STRN3Q13033 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
STRN3Q13033 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
STRN3Q13033 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
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STRN3Q13033 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
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STRN3Q13033 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
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STRN3Q13033 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
STRN3Q13033 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
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STRN3Q13033 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
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STRN3Q13033 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
STRN3Q13033 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
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STRN3Q13033 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
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STRN3Q13033 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC20.69■□□□□ 0.9
STRN3Q13033 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
STRN3Q13033 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
STRN3Q13033 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
STRN3Q13033 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
STRN3Q13033 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
STRN3Q13033 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
STRN3Q13033 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
STRN3Q13033 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
STRN3Q13033 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
STRN3Q13033 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
STRN3Q13033 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
STRN3Q13033 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
STRN3Q13033 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
STRN3Q13033 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
STRN3Q13033 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
STRN3Q13033 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
STRN3Q13033 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
STRN3Q13033 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
STRN3Q13033 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
STRN3Q13033 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
STRN3Q13033 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC20.68■□□□□ 0.9
STRN3Q13033 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC20.68■□□□□ 0.9
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