Protein–RNA interactions for Protein: Q13003

GRIK3, Glutamate receptor ionotropic, kainate 3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK3Q13003 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
GRIK3Q13003 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
GRIK3Q13003 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
GRIK3Q13003 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
GRIK3Q13003 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
GRIK3Q13003 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
GRIK3Q13003 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
GRIK3Q13003 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
GRIK3Q13003 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
GRIK3Q13003 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
GRIK3Q13003 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
GRIK3Q13003 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
GRIK3Q13003 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
GRIK3Q13003 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
GRIK3Q13003 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
GRIK3Q13003 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
GRIK3Q13003 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
GRIK3Q13003 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
GRIK3Q13003 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
GRIK3Q13003 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
GRIK3Q13003 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
GRIK3Q13003 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
GRIK3Q13003 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
GRIK3Q13003 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
GRIK3Q13003 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
GRIK3Q13003 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
GRIK3Q13003 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
GRIK3Q13003 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
GRIK3Q13003 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
GRIK3Q13003 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
GRIK3Q13003 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
GRIK3Q13003 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
GRIK3Q13003 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
GRIK3Q13003 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
GRIK3Q13003 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
GRIK3Q13003 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
GRIK3Q13003 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
GRIK3Q13003 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
GRIK3Q13003 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
GRIK3Q13003 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
GRIK3Q13003 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
GRIK3Q13003 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
GRIK3Q13003 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
GRIK3Q13003 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
GRIK3Q13003 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
GRIK3Q13003 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
GRIK3Q13003 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
GRIK3Q13003 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
GRIK3Q13003 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
GRIK3Q13003 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
GRIK3Q13003 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
GRIK3Q13003 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
GRIK3Q13003 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
GRIK3Q13003 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
GRIK3Q13003 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
GRIK3Q13003 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
GRIK3Q13003 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
GRIK3Q13003 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
GRIK3Q13003 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
GRIK3Q13003 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
GRIK3Q13003 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
GRIK3Q13003 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
GRIK3Q13003 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
GRIK3Q13003 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
GRIK3Q13003 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
GRIK3Q13003 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
GRIK3Q13003 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
GRIK3Q13003 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
GRIK3Q13003 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
GRIK3Q13003 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
GRIK3Q13003 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
GRIK3Q13003 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
GRIK3Q13003 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
GRIK3Q13003 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
GRIK3Q13003 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
GRIK3Q13003 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
GRIK3Q13003 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
GRIK3Q13003 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
GRIK3Q13003 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
GRIK3Q13003 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
GRIK3Q13003 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
GRIK3Q13003 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
GRIK3Q13003 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
GRIK3Q13003 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
GRIK3Q13003 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
GRIK3Q13003 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
GRIK3Q13003 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
GRIK3Q13003 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
GRIK3Q13003 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
GRIK3Q13003 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
GRIK3Q13003 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
GRIK3Q13003 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
GRIK3Q13003 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
GRIK3Q13003 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
GRIK3Q13003 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
GRIK3Q13003 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
GRIK3Q13003 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
GRIK3Q13003 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
GRIK3Q13003 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
GRIK3Q13003 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
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