Protein–RNA interactions for Protein: Q12988

HSPB3, Heat shock protein beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 150 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HSPB3Q12988 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
HSPB3Q12988 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
HSPB3Q12988 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
HSPB3Q12988 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
HSPB3Q12988 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
HSPB3Q12988 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
HSPB3Q12988 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
HSPB3Q12988 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
HSPB3Q12988 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
HSPB3Q12988 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
HSPB3Q12988 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
HSPB3Q12988 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
HSPB3Q12988 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
HSPB3Q12988 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
HSPB3Q12988 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
HSPB3Q12988 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
HSPB3Q12988 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
HSPB3Q12988 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
HSPB3Q12988 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
HSPB3Q12988 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
HSPB3Q12988 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
HSPB3Q12988 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
HSPB3Q12988 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
HSPB3Q12988 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
HSPB3Q12988 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
HSPB3Q12988 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
HSPB3Q12988 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
HSPB3Q12988 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
HSPB3Q12988 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
HSPB3Q12988 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
HSPB3Q12988 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
HSPB3Q12988 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
HSPB3Q12988 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
HSPB3Q12988 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
HSPB3Q12988 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
HSPB3Q12988 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
HSPB3Q12988 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
HSPB3Q12988 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
HSPB3Q12988 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
HSPB3Q12988 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
HSPB3Q12988 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
HSPB3Q12988 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
HSPB3Q12988 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
HSPB3Q12988 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
HSPB3Q12988 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
HSPB3Q12988 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
HSPB3Q12988 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
HSPB3Q12988 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
HSPB3Q12988 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
HSPB3Q12988 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
HSPB3Q12988 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
HSPB3Q12988 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
HSPB3Q12988 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
HSPB3Q12988 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
HSPB3Q12988 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
HSPB3Q12988 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
HSPB3Q12988 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
HSPB3Q12988 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
HSPB3Q12988 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
HSPB3Q12988 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
HSPB3Q12988 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
HSPB3Q12988 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
HSPB3Q12988 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
HSPB3Q12988 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
HSPB3Q12988 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
HSPB3Q12988 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
HSPB3Q12988 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
HSPB3Q12988 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
HSPB3Q12988 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
HSPB3Q12988 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
HSPB3Q12988 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
HSPB3Q12988 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC17.81■□□□□ 0.44
HSPB3Q12988 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
HSPB3Q12988 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
HSPB3Q12988 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC17.81■□□□□ 0.44
HSPB3Q12988 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
HSPB3Q12988 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
HSPB3Q12988 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
HSPB3Q12988 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
HSPB3Q12988 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
HSPB3Q12988 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
HSPB3Q12988 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
HSPB3Q12988 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
HSPB3Q12988 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
HSPB3Q12988 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
HSPB3Q12988 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
HSPB3Q12988 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
HSPB3Q12988 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
HSPB3Q12988 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
HSPB3Q12988 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
HSPB3Q12988 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
HSPB3Q12988 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
HSPB3Q12988 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
HSPB3Q12988 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
HSPB3Q12988 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
HSPB3Q12988 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
HSPB3Q12988 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
HSPB3Q12988 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
HSPB3Q12988 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
HSPB3Q12988 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.4 ms