Protein–RNA interactions for Protein: Q12981

BNIP1, Vesicle transport protein SEC20, humanhuman

Predictions only

Length 228 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BNIP1Q12981 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
BNIP1Q12981 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
BNIP1Q12981 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
BNIP1Q12981 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
BNIP1Q12981 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
BNIP1Q12981 ZNF454-201ENST00000320129 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
BNIP1Q12981 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
BNIP1Q12981 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
BNIP1Q12981 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
BNIP1Q12981 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
BNIP1Q12981 TLK2-201ENST00000326270 3512 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
BNIP1Q12981 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
BNIP1Q12981 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
BNIP1Q12981 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
BNIP1Q12981 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
BNIP1Q12981 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
BNIP1Q12981 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
BNIP1Q12981 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
BNIP1Q12981 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
BNIP1Q12981 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
BNIP1Q12981 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
BNIP1Q12981 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
BNIP1Q12981 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
BNIP1Q12981 AC018695.7-201ENST00000624587 2492 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
BNIP1Q12981 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
BNIP1Q12981 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
BNIP1Q12981 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
BNIP1Q12981 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
BNIP1Q12981 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
BNIP1Q12981 AL118508.1-201ENST00000613502 2345 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
BNIP1Q12981 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
BNIP1Q12981 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
BNIP1Q12981 DCAF12L2-201ENST00000360028 2599 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
BNIP1Q12981 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
BNIP1Q12981 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
BNIP1Q12981 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
BNIP1Q12981 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
BNIP1Q12981 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
BNIP1Q12981 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
BNIP1Q12981 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
BNIP1Q12981 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
BNIP1Q12981 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
BNIP1Q12981 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
BNIP1Q12981 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
BNIP1Q12981 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
BNIP1Q12981 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
BNIP1Q12981 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
BNIP1Q12981 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
BNIP1Q12981 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
BNIP1Q12981 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
BNIP1Q12981 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
BNIP1Q12981 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
BNIP1Q12981 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
BNIP1Q12981 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
BNIP1Q12981 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
BNIP1Q12981 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
BNIP1Q12981 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
BNIP1Q12981 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
BNIP1Q12981 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
BNIP1Q12981 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
BNIP1Q12981 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
BNIP1Q12981 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
BNIP1Q12981 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
BNIP1Q12981 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
BNIP1Q12981 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
BNIP1Q12981 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
BNIP1Q12981 AL079303.2-201ENST00000555107 2613 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
BNIP1Q12981 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
BNIP1Q12981 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
BNIP1Q12981 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
BNIP1Q12981 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
BNIP1Q12981 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
BNIP1Q12981 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
BNIP1Q12981 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC18.31■□□□□ 0.52
BNIP1Q12981 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
BNIP1Q12981 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
BNIP1Q12981 JKAMP-202ENST00000356057 2524 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
BNIP1Q12981 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
BNIP1Q12981 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
BNIP1Q12981 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
BNIP1Q12981 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
BNIP1Q12981 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
BNIP1Q12981 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
BNIP1Q12981 STAT5A-207ENST00000546010 3086 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
BNIP1Q12981 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
BNIP1Q12981 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
BNIP1Q12981 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
BNIP1Q12981 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
BNIP1Q12981 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
BNIP1Q12981 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
BNIP1Q12981 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
BNIP1Q12981 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
BNIP1Q12981 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
BNIP1Q12981 MAFB-201ENST00000373313 3393 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
BNIP1Q12981 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
BNIP1Q12981 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
BNIP1Q12981 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
BNIP1Q12981 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
BNIP1Q12981 LINC01215-201ENST00000607746 2592 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
BNIP1Q12981 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
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