Protein–RNA interactions for Protein: Q12951

FOXI1, Forkhead box protein I1, humanhuman

Predictions only

Length 378 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXI1Q12951 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
FOXI1Q12951 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
FOXI1Q12951 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
FOXI1Q12951 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
FOXI1Q12951 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
FOXI1Q12951 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
FOXI1Q12951 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
FOXI1Q12951 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
FOXI1Q12951 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
FOXI1Q12951 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
FOXI1Q12951 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
FOXI1Q12951 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
FOXI1Q12951 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
FOXI1Q12951 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
FOXI1Q12951 TJP1-212ENST00000614355 6977 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
FOXI1Q12951 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
FOXI1Q12951 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
FOXI1Q12951 TSSK2-201ENST00000399635 1816 ntAPPRIS P1 BASIC13.2□□□□□ -0.3
FOXI1Q12951 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
FOXI1Q12951 NFATC4-211ENST00000554344 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
FOXI1Q12951 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
FOXI1Q12951 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
FOXI1Q12951 RANBP9-201ENST00000011619 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
FOXI1Q12951 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
FOXI1Q12951 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
FOXI1Q12951 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
FOXI1Q12951 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
FOXI1Q12951 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
FOXI1Q12951 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
FOXI1Q12951 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
FOXI1Q12951 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
FOXI1Q12951 CAMK2D-201ENST00000296402 5820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
FOXI1Q12951 WNK2-201ENST00000297954 7138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
FOXI1Q12951 C17orf113-201ENST00000587304 3746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
FOXI1Q12951 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
FOXI1Q12951 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
FOXI1Q12951 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
FOXI1Q12951 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
FOXI1Q12951 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
FOXI1Q12951 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
FOXI1Q12951 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
FOXI1Q12951 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
FOXI1Q12951 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
FOXI1Q12951 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
FOXI1Q12951 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
FOXI1Q12951 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
FOXI1Q12951 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC13.19□□□□□ -0.3
FOXI1Q12951 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
FOXI1Q12951 MAPT-205ENST00000351559 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
FOXI1Q12951 PHACTR3-204ENST00000371015 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
FOXI1Q12951 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
FOXI1Q12951 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
FOXI1Q12951 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
FOXI1Q12951 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
FOXI1Q12951 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
FOXI1Q12951 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
FOXI1Q12951 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
FOXI1Q12951 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
FOXI1Q12951 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
FOXI1Q12951 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
FOXI1Q12951 TPBG-203ENST00000543496 2881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
FOXI1Q12951 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
FOXI1Q12951 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
FOXI1Q12951 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
FOXI1Q12951 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
FOXI1Q12951 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
FOXI1Q12951 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
FOXI1Q12951 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
FOXI1Q12951 WASF1-206ENST00000392588 3122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
FOXI1Q12951 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
FOXI1Q12951 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
FOXI1Q12951 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
FOXI1Q12951 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
FOXI1Q12951 BMPER-201ENST00000297161 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
FOXI1Q12951 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
FOXI1Q12951 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
FOXI1Q12951 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
FOXI1Q12951 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC13.18□□□□□ -0.3
FOXI1Q12951 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
FOXI1Q12951 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
FOXI1Q12951 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
FOXI1Q12951 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
FOXI1Q12951 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
FOXI1Q12951 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
FOXI1Q12951 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
FOXI1Q12951 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
FOXI1Q12951 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
FOXI1Q12951 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
FOXI1Q12951 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
FOXI1Q12951 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
FOXI1Q12951 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
FOXI1Q12951 HSPA1A-201ENST00000375651 2483 ntAPPRIS P1 BASIC13.18□□□□□ -0.3
FOXI1Q12951 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
FOXI1Q12951 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
FOXI1Q12951 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
FOXI1Q12951 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
FOXI1Q12951 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
FOXI1Q12951 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
FOXI1Q12951 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
FOXI1Q12951 TTLL11-201ENST00000321582 3250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.9 ms