Protein–RNA interactions for Protein: Q12913

PTPRJ, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase eta, humanhuman

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Length 1,337 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRJQ12913 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PTPRJQ12913 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PTPRJQ12913 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
PTPRJQ12913 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
PTPRJQ12913 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
PTPRJQ12913 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
PTPRJQ12913 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
PTPRJQ12913 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
PTPRJQ12913 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
PTPRJQ12913 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
PTPRJQ12913 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
PTPRJQ12913 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
PTPRJQ12913 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
PTPRJQ12913 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PTPRJQ12913 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PTPRJQ12913 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PTPRJQ12913 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PTPRJQ12913 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
PTPRJQ12913 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
PTPRJQ12913 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PTPRJQ12913 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PTPRJQ12913 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
PTPRJQ12913 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
PTPRJQ12913 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PTPRJQ12913 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PTPRJQ12913 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
PTPRJQ12913 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PTPRJQ12913 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
PTPRJQ12913 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PTPRJQ12913 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PTPRJQ12913 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PTPRJQ12913 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PTPRJQ12913 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PTPRJQ12913 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
PTPRJQ12913 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PTPRJQ12913 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PTPRJQ12913 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
PTPRJQ12913 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
PTPRJQ12913 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
PTPRJQ12913 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
PTPRJQ12913 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
PTPRJQ12913 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PTPRJQ12913 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PTPRJQ12913 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PTPRJQ12913 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PTPRJQ12913 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
PTPRJQ12913 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PTPRJQ12913 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PTPRJQ12913 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
PTPRJQ12913 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
PTPRJQ12913 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PTPRJQ12913 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PTPRJQ12913 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
PTPRJQ12913 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
PTPRJQ12913 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
PTPRJQ12913 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
PTPRJQ12913 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
PTPRJQ12913 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
PTPRJQ12913 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
PTPRJQ12913 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
PTPRJQ12913 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
PTPRJQ12913 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
PTPRJQ12913 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
PTPRJQ12913 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
PTPRJQ12913 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
PTPRJQ12913 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
PTPRJQ12913 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
PTPRJQ12913 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
PTPRJQ12913 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
PTPRJQ12913 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
PTPRJQ12913 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC20.27■□□□□ 0.83
PTPRJQ12913 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
PTPRJQ12913 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC20.27■□□□□ 0.83
PTPRJQ12913 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.83
PTPRJQ12913 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
PTPRJQ12913 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC20.27■□□□□ 0.83
PTPRJQ12913 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
PTPRJQ12913 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.83
PTPRJQ12913 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.83
PTPRJQ12913 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PTPRJQ12913 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
PTPRJQ12913 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
PTPRJQ12913 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
PTPRJQ12913 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PTPRJQ12913 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PTPRJQ12913 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PTPRJQ12913 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PTPRJQ12913 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PTPRJQ12913 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PTPRJQ12913 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PTPRJQ12913 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PTPRJQ12913 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
PTPRJQ12913 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PTPRJQ12913 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PTPRJQ12913 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PTPRJQ12913 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
PTPRJQ12913 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
PTPRJQ12913 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
PTPRJQ12913 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
PTPRJQ12913 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
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