Protein–RNA interactions for Protein: Q12829

RAB40B, Ras-related protein Rab-40B, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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RAB40BQ12829 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
RAB40BQ12829 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
RAB40BQ12829 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
RAB40BQ12829 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
RAB40BQ12829 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
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RAB40BQ12829 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
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RAB40BQ12829 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
RAB40BQ12829 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
RAB40BQ12829 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
RAB40BQ12829 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
RAB40BQ12829 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
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RAB40BQ12829 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
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RAB40BQ12829 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
RAB40BQ12829 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
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RAB40BQ12829 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
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RAB40BQ12829 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
RAB40BQ12829 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
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RAB40BQ12829 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
RAB40BQ12829 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
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RAB40BQ12829 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
RAB40BQ12829 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
RAB40BQ12829 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
RAB40BQ12829 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
RAB40BQ12829 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
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