Protein–RNA interactions for Protein: Q08493

PDE4C, cAMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase 4C, humanhuman

Predictions only

Length 712 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4CQ08493 ZNF804A-201ENST00000302277 4690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
PDE4CQ08493 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
PDE4CQ08493 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
PDE4CQ08493 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
PDE4CQ08493 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
PDE4CQ08493 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
PDE4CQ08493 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
PDE4CQ08493 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
PDE4CQ08493 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
PDE4CQ08493 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
PDE4CQ08493 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
PDE4CQ08493 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
PDE4CQ08493 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
PDE4CQ08493 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
PDE4CQ08493 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
PDE4CQ08493 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
PDE4CQ08493 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
PDE4CQ08493 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
PDE4CQ08493 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
PDE4CQ08493 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
PDE4CQ08493 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
PDE4CQ08493 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
PDE4CQ08493 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
PDE4CQ08493 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
PDE4CQ08493 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
PDE4CQ08493 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
PDE4CQ08493 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
PDE4CQ08493 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
PDE4CQ08493 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
PDE4CQ08493 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
PDE4CQ08493 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
PDE4CQ08493 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
PDE4CQ08493 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
PDE4CQ08493 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
PDE4CQ08493 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
PDE4CQ08493 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
PDE4CQ08493 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
PDE4CQ08493 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
PDE4CQ08493 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
PDE4CQ08493 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
PDE4CQ08493 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
PDE4CQ08493 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
PDE4CQ08493 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
PDE4CQ08493 SYBU-207ENST00000433638 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
PDE4CQ08493 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
PDE4CQ08493 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
PDE4CQ08493 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
PDE4CQ08493 CEP120-201ENST00000306467 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
PDE4CQ08493 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
PDE4CQ08493 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
PDE4CQ08493 LINC01168-201ENST00000461291 5254 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
PDE4CQ08493 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
PDE4CQ08493 CDK16-202ENST00000357227 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
PDE4CQ08493 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
PDE4CQ08493 IL12RB2-201ENST00000262345 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
PDE4CQ08493 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
PDE4CQ08493 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
PDE4CQ08493 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
PDE4CQ08493 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
PDE4CQ08493 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
PDE4CQ08493 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
PDE4CQ08493 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.92
PDE4CQ08493 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.92
PDE4CQ08493 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.92
PDE4CQ08493 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
PDE4CQ08493 CBARP-204ENST00000590083 4261 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
PDE4CQ08493 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
PDE4CQ08493 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
PDE4CQ08493 RTN3-205ENST00000356000 2645 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
PDE4CQ08493 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
PDE4CQ08493 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
PDE4CQ08493 FAM208B-201ENST00000328090 8626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
PDE4CQ08493 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
PDE4CQ08493 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
PDE4CQ08493 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
PDE4CQ08493 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
PDE4CQ08493 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC20.77■□□□□ 0.91
PDE4CQ08493 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
PDE4CQ08493 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
PDE4CQ08493 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
PDE4CQ08493 PLXND1-201ENST00000324093 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
PDE4CQ08493 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
PDE4CQ08493 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
PDE4CQ08493 ZNF324-203ENST00000536459 5653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
PDE4CQ08493 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
PDE4CQ08493 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
PDE4CQ08493 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
PDE4CQ08493 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC20.76■□□□□ 0.91
PDE4CQ08493 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC20.76■□□□□ 0.91
PDE4CQ08493 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
PDE4CQ08493 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
PDE4CQ08493 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
PDE4CQ08493 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
PDE4CQ08493 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
PDE4CQ08493 DTX2-201ENST00000324432 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
PDE4CQ08493 COBL-201ENST00000265136 5291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
PDE4CQ08493 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
PDE4CQ08493 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
PDE4CQ08493 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
PDE4CQ08493 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.4 ms