Protein–RNA interactions for Protein: Q08289

CACNB2, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit beta-2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 660 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNB2Q08289 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
CACNB2Q08289 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CACNB2Q08289 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CACNB2Q08289 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CACNB2Q08289 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CACNB2Q08289 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CACNB2Q08289 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CACNB2Q08289 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
CACNB2Q08289 AC104532.1-201ENST00000588891 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CACNB2Q08289 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CACNB2Q08289 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CACNB2Q08289 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CACNB2Q08289 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CACNB2Q08289 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CACNB2Q08289 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CACNB2Q08289 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CACNB2Q08289 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CACNB2Q08289 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CACNB2Q08289 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CACNB2Q08289 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CACNB2Q08289 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CACNB2Q08289 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CACNB2Q08289 AL590627.1-203ENST00000421194 1026 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
CACNB2Q08289 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CACNB2Q08289 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CACNB2Q08289 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CACNB2Q08289 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CACNB2Q08289 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CACNB2Q08289 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CACNB2Q08289 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CACNB2Q08289 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CACNB2Q08289 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CACNB2Q08289 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CACNB2Q08289 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CACNB2Q08289 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CACNB2Q08289 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CACNB2Q08289 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CACNB2Q08289 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CACNB2Q08289 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CACNB2Q08289 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CACNB2Q08289 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CACNB2Q08289 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
CACNB2Q08289 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CACNB2Q08289 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CACNB2Q08289 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CACNB2Q08289 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CACNB2Q08289 NME4-212ENST00000621774 904 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CACNB2Q08289 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CACNB2Q08289 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CACNB2Q08289 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CACNB2Q08289 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CACNB2Q08289 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CACNB2Q08289 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CACNB2Q08289 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CACNB2Q08289 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CACNB2Q08289 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CACNB2Q08289 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CACNB2Q08289 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CACNB2Q08289 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CACNB2Q08289 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CACNB2Q08289 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CACNB2Q08289 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CACNB2Q08289 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CACNB2Q08289 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CACNB2Q08289 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CACNB2Q08289 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CACNB2Q08289 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
CACNB2Q08289 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CACNB2Q08289 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CACNB2Q08289 AC139530.3-201ENST00000620344 690 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
CACNB2Q08289 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CACNB2Q08289 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
CACNB2Q08289 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CACNB2Q08289 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CACNB2Q08289 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CACNB2Q08289 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
CACNB2Q08289 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CACNB2Q08289 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CACNB2Q08289 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CACNB2Q08289 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CACNB2Q08289 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CACNB2Q08289 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CACNB2Q08289 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CACNB2Q08289 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CACNB2Q08289 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CACNB2Q08289 AL512343.2-201ENST00000609423 490 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CACNB2Q08289 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CACNB2Q08289 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CACNB2Q08289 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CACNB2Q08289 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CACNB2Q08289 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CACNB2Q08289 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CACNB2Q08289 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CACNB2Q08289 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CACNB2Q08289 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CACNB2Q08289 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CACNB2Q08289 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CACNB2Q08289 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CACNB2Q08289 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CACNB2Q08289 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.4 ms