Protein–RNA interactions for Protein: Q08211

DHX9, ATP-dependent RNA helicase A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DHX9Q08211 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
DHX9Q08211 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
DHX9Q08211 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
DHX9Q08211 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
DHX9Q08211 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
DHX9Q08211 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
DHX9Q08211 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
DHX9Q08211 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
DHX9Q08211 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC19.55■□□□□ 0.72
DHX9Q08211 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
DHX9Q08211 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
DHX9Q08211 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
DHX9Q08211 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
DHX9Q08211 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
DHX9Q08211 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
DHX9Q08211 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
DHX9Q08211 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
DHX9Q08211 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
DHX9Q08211 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
DHX9Q08211 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
DHX9Q08211 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
DHX9Q08211 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
DHX9Q08211 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
DHX9Q08211 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
DHX9Q08211 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
DHX9Q08211 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
DHX9Q08211 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
DHX9Q08211 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
DHX9Q08211 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
DHX9Q08211 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
DHX9Q08211 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
DHX9Q08211 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
DHX9Q08211 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
DHX9Q08211 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
DHX9Q08211 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
DHX9Q08211 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
DHX9Q08211 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
DHX9Q08211 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
DHX9Q08211 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
DHX9Q08211 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
DHX9Q08211 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
DHX9Q08211 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
DHX9Q08211 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
DHX9Q08211 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
DHX9Q08211 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
DHX9Q08211 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
DHX9Q08211 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
DHX9Q08211 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
DHX9Q08211 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
DHX9Q08211 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
DHX9Q08211 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
DHX9Q08211 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
DHX9Q08211 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
DHX9Q08211 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
DHX9Q08211 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
DHX9Q08211 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
DHX9Q08211 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
DHX9Q08211 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
DHX9Q08211 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
DHX9Q08211 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
DHX9Q08211 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
DHX9Q08211 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
DHX9Q08211 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
DHX9Q08211 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
DHX9Q08211 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
DHX9Q08211 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
DHX9Q08211 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
DHX9Q08211 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
DHX9Q08211 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
DHX9Q08211 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
DHX9Q08211 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
DHX9Q08211 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
DHX9Q08211 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
DHX9Q08211 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
DHX9Q08211 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
DHX9Q08211 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
DHX9Q08211 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
DHX9Q08211 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
DHX9Q08211 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC19.52■□□□□ 0.72
DHX9Q08211 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
DHX9Q08211 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
DHX9Q08211 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
DHX9Q08211 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
DHX9Q08211 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
DHX9Q08211 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
DHX9Q08211 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
DHX9Q08211 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
DHX9Q08211 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
DHX9Q08211 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
DHX9Q08211 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
DHX9Q08211 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
DHX9Q08211 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
DHX9Q08211 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
DHX9Q08211 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
DHX9Q08211 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
DHX9Q08211 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
DHX9Q08211 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
DHX9Q08211 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
DHX9Q08211 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
DHX9Q08211 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.5 ms