Protein–RNA interactions for Protein: Q08188

TGM3, Protein-glutamine gamma-glutamyltransferase E, humanhuman

Predictions only

Length 693 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TGM3Q08188 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TGM3Q08188 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TGM3Q08188 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TGM3Q08188 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TGM3Q08188 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TGM3Q08188 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TGM3Q08188 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TGM3Q08188 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TGM3Q08188 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TGM3Q08188 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TGM3Q08188 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
TGM3Q08188 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TGM3Q08188 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TGM3Q08188 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
TGM3Q08188 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TGM3Q08188 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TGM3Q08188 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
TGM3Q08188 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TGM3Q08188 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TGM3Q08188 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TGM3Q08188 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TGM3Q08188 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TGM3Q08188 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TGM3Q08188 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TGM3Q08188 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TGM3Q08188 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TGM3Q08188 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TGM3Q08188 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TGM3Q08188 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TGM3Q08188 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TGM3Q08188 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TGM3Q08188 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TGM3Q08188 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
TGM3Q08188 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TGM3Q08188 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TGM3Q08188 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TGM3Q08188 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TGM3Q08188 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TGM3Q08188 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TGM3Q08188 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TGM3Q08188 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TGM3Q08188 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
TGM3Q08188 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TGM3Q08188 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TGM3Q08188 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TGM3Q08188 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TGM3Q08188 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TGM3Q08188 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TGM3Q08188 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TGM3Q08188 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TGM3Q08188 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TGM3Q08188 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TGM3Q08188 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TGM3Q08188 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TGM3Q08188 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TGM3Q08188 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TGM3Q08188 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TGM3Q08188 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TGM3Q08188 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TGM3Q08188 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TGM3Q08188 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TGM3Q08188 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TGM3Q08188 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TGM3Q08188 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TGM3Q08188 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TGM3Q08188 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TGM3Q08188 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TGM3Q08188 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TGM3Q08188 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TGM3Q08188 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TGM3Q08188 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TGM3Q08188 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
TGM3Q08188 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TGM3Q08188 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TGM3Q08188 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TGM3Q08188 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TGM3Q08188 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TGM3Q08188 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TGM3Q08188 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TGM3Q08188 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TGM3Q08188 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TGM3Q08188 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TGM3Q08188 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
TGM3Q08188 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
TGM3Q08188 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
TGM3Q08188 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
TGM3Q08188 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
TGM3Q08188 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC18.02■□□□□ 0.47
TGM3Q08188 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TGM3Q08188 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TGM3Q08188 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TGM3Q08188 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TGM3Q08188 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TGM3Q08188 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TGM3Q08188 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TGM3Q08188 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TGM3Q08188 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TGM3Q08188 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TGM3Q08188 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TGM3Q08188 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 85 ms