Protein–RNA interactions for Protein: Q04727

TLE4, Transducin-like enhancer protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 773 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TLE4Q04727 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
TLE4Q04727 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
TLE4Q04727 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TLE4Q04727 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
TLE4Q04727 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
TLE4Q04727 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TLE4Q04727 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TLE4Q04727 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TLE4Q04727 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
TLE4Q04727 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
TLE4Q04727 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
TLE4Q04727 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TLE4Q04727 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TLE4Q04727 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TLE4Q04727 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TLE4Q04727 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
TLE4Q04727 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
TLE4Q04727 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
TLE4Q04727 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
TLE4Q04727 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
TLE4Q04727 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
TLE4Q04727 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
TLE4Q04727 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
TLE4Q04727 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
TLE4Q04727 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
TLE4Q04727 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
TLE4Q04727 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
TLE4Q04727 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
TLE4Q04727 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
TLE4Q04727 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
TLE4Q04727 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
TLE4Q04727 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
TLE4Q04727 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
TLE4Q04727 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
TLE4Q04727 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
TLE4Q04727 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
TLE4Q04727 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
TLE4Q04727 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
TLE4Q04727 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
TLE4Q04727 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
TLE4Q04727 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
TLE4Q04727 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
TLE4Q04727 SUV39H2-202ENST00000354919 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
TLE4Q04727 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
TLE4Q04727 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
TLE4Q04727 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
TLE4Q04727 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
TLE4Q04727 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
TLE4Q04727 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
TLE4Q04727 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
TLE4Q04727 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
TLE4Q04727 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
TLE4Q04727 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
TLE4Q04727 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
TLE4Q04727 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
TLE4Q04727 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
TLE4Q04727 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
TLE4Q04727 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
TLE4Q04727 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
TLE4Q04727 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
TLE4Q04727 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
TLE4Q04727 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
TLE4Q04727 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
TLE4Q04727 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
TLE4Q04727 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
TLE4Q04727 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
TLE4Q04727 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
TLE4Q04727 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
TLE4Q04727 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
TLE4Q04727 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
TLE4Q04727 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
TLE4Q04727 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
TLE4Q04727 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
TLE4Q04727 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
TLE4Q04727 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
TLE4Q04727 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
TLE4Q04727 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
TLE4Q04727 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
TLE4Q04727 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
TLE4Q04727 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
TLE4Q04727 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
TLE4Q04727 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC16.63■□□□□ 0.25
TLE4Q04727 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
TLE4Q04727 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
TLE4Q04727 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
TLE4Q04727 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
TLE4Q04727 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
TLE4Q04727 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
TLE4Q04727 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
TLE4Q04727 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
TLE4Q04727 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
TLE4Q04727 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
TLE4Q04727 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
TLE4Q04727 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
TLE4Q04727 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TLE4Q04727 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
TLE4Q04727 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
TLE4Q04727 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TLE4Q04727 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TLE4Q04727 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.7 ms