Protein–RNA interactions for Protein: Q04206

RELA, Transcription factor p65, humanhuman

Predictions only

Length 551 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RELAQ04206 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
RELAQ04206 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
RELAQ04206 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
RELAQ04206 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
RELAQ04206 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
RELAQ04206 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
RELAQ04206 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
RELAQ04206 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
RELAQ04206 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
RELAQ04206 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
RELAQ04206 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
RELAQ04206 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
RELAQ04206 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
RELAQ04206 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
RELAQ04206 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
RELAQ04206 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
RELAQ04206 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
RELAQ04206 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
RELAQ04206 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RELAQ04206 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RELAQ04206 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RELAQ04206 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RELAQ04206 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RELAQ04206 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RELAQ04206 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
RELAQ04206 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RELAQ04206 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RELAQ04206 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
RELAQ04206 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC18.26■□□□□ 0.51
RELAQ04206 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
RELAQ04206 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RELAQ04206 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
RELAQ04206 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RELAQ04206 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RELAQ04206 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RELAQ04206 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
RELAQ04206 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
RELAQ04206 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RELAQ04206 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RELAQ04206 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RELAQ04206 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
RELAQ04206 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
RELAQ04206 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
RELAQ04206 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
RELAQ04206 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RELAQ04206 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RELAQ04206 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RELAQ04206 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RELAQ04206 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
RELAQ04206 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RELAQ04206 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
RELAQ04206 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RELAQ04206 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RELAQ04206 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RELAQ04206 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RELAQ04206 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RELAQ04206 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
RELAQ04206 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
RELAQ04206 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
RELAQ04206 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
RELAQ04206 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RELAQ04206 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
RELAQ04206 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
RELAQ04206 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
RELAQ04206 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.25■□□□□ 0.51
RELAQ04206 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RELAQ04206 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RELAQ04206 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
RELAQ04206 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
RELAQ04206 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
RELAQ04206 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RELAQ04206 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RELAQ04206 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
RELAQ04206 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RELAQ04206 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RELAQ04206 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
RELAQ04206 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
RELAQ04206 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
RELAQ04206 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
RELAQ04206 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RELAQ04206 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
RELAQ04206 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RELAQ04206 KMT5A-202ENST00000402868 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RELAQ04206 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RELAQ04206 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RELAQ04206 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RELAQ04206 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
RELAQ04206 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
RELAQ04206 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
RELAQ04206 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
RELAQ04206 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RELAQ04206 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RELAQ04206 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC18.24■□□□□ 0.51
RELAQ04206 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RELAQ04206 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
RELAQ04206 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RELAQ04206 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC18.24■□□□□ 0.51
RELAQ04206 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RELAQ04206 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
RELAQ04206 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.7 ms