Protein–RNA interactions for Protein: Q03989

ARID5A, AT-rich interactive domain-containing protein 5A, humanhuman

Predictions only

Length 594 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARID5AQ03989 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
ARID5AQ03989 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC20.51■□□□□ 0.87
ARID5AQ03989 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
ARID5AQ03989 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
ARID5AQ03989 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
ARID5AQ03989 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
ARID5AQ03989 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
ARID5AQ03989 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
ARID5AQ03989 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ARID5AQ03989 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ARID5AQ03989 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
ARID5AQ03989 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ARID5AQ03989 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ARID5AQ03989 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ARID5AQ03989 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ARID5AQ03989 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ARID5AQ03989 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ARID5AQ03989 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ARID5AQ03989 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ARID5AQ03989 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ARID5AQ03989 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ARID5AQ03989 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ARID5AQ03989 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ARID5AQ03989 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ARID5AQ03989 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ARID5AQ03989 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ARID5AQ03989 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ARID5AQ03989 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ARID5AQ03989 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ARID5AQ03989 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ARID5AQ03989 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ARID5AQ03989 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ARID5AQ03989 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ARID5AQ03989 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ARID5AQ03989 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ARID5AQ03989 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ARID5AQ03989 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ARID5AQ03989 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ARID5AQ03989 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ARID5AQ03989 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ARID5AQ03989 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ARID5AQ03989 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ARID5AQ03989 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ARID5AQ03989 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ARID5AQ03989 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ARID5AQ03989 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ARID5AQ03989 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ARID5AQ03989 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ARID5AQ03989 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ARID5AQ03989 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ARID5AQ03989 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ARID5AQ03989 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ARID5AQ03989 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ARID5AQ03989 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ARID5AQ03989 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ARID5AQ03989 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ARID5AQ03989 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ARID5AQ03989 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ARID5AQ03989 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ARID5AQ03989 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ARID5AQ03989 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ARID5AQ03989 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ARID5AQ03989 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ARID5AQ03989 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ARID5AQ03989 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ARID5AQ03989 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ARID5AQ03989 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ARID5AQ03989 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ARID5AQ03989 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ARID5AQ03989 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ARID5AQ03989 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ARID5AQ03989 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ARID5AQ03989 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ARID5AQ03989 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ARID5AQ03989 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ARID5AQ03989 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ARID5AQ03989 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ARID5AQ03989 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ARID5AQ03989 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ARID5AQ03989 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ARID5AQ03989 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ARID5AQ03989 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ARID5AQ03989 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ARID5AQ03989 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ARID5AQ03989 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
ARID5AQ03989 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ARID5AQ03989 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ARID5AQ03989 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ARID5AQ03989 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ARID5AQ03989 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ARID5AQ03989 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ARID5AQ03989 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ARID5AQ03989 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ARID5AQ03989 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
ARID5AQ03989 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ARID5AQ03989 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ARID5AQ03989 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ARID5AQ03989 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ARID5AQ03989 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ARID5AQ03989 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.3 ms