Protein–RNA interactions for Protein: Q02535

ID3, DNA-binding protein inhibitor ID-3, humanhuman

Predictions only

Length 119 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ID3Q02535 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ID3Q02535 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ID3Q02535 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ID3Q02535 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ID3Q02535 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ID3Q02535 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ID3Q02535 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ID3Q02535 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ID3Q02535 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ID3Q02535 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ID3Q02535 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ID3Q02535 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ID3Q02535 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ID3Q02535 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
ID3Q02535 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ID3Q02535 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ID3Q02535 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ID3Q02535 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ID3Q02535 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ID3Q02535 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ID3Q02535 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ID3Q02535 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ID3Q02535 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ID3Q02535 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ID3Q02535 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ID3Q02535 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ID3Q02535 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ID3Q02535 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ID3Q02535 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ID3Q02535 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ID3Q02535 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ID3Q02535 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ID3Q02535 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ID3Q02535 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ID3Q02535 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ID3Q02535 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ID3Q02535 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ID3Q02535 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ID3Q02535 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ID3Q02535 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ID3Q02535 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ID3Q02535 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ID3Q02535 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ID3Q02535 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ID3Q02535 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ID3Q02535 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ID3Q02535 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ID3Q02535 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ID3Q02535 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ID3Q02535 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ID3Q02535 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ID3Q02535 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ID3Q02535 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ID3Q02535 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ID3Q02535 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ID3Q02535 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ID3Q02535 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ID3Q02535 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ID3Q02535 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ID3Q02535 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ID3Q02535 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ID3Q02535 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ID3Q02535 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ID3Q02535 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ID3Q02535 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ID3Q02535 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ID3Q02535 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ID3Q02535 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ID3Q02535 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ID3Q02535 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ID3Q02535 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ID3Q02535 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ID3Q02535 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ID3Q02535 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ID3Q02535 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ID3Q02535 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
ID3Q02535 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ID3Q02535 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ID3Q02535 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ID3Q02535 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ID3Q02535 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ID3Q02535 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
ID3Q02535 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ID3Q02535 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
ID3Q02535 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ID3Q02535 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ID3Q02535 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ID3Q02535 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ID3Q02535 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ID3Q02535 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ID3Q02535 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
ID3Q02535 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ID3Q02535 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ID3Q02535 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ID3Q02535 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ID3Q02535 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
ID3Q02535 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC15.21■□□□□ 0.02
ID3Q02535 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
ID3Q02535 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
ID3Q02535 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.6 ms