Protein–RNA interactions for Protein: Q02413

DSG1, Desmoglein-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,049 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DSG1Q02413 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
DSG1Q02413 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
DSG1Q02413 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
DSG1Q02413 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
DSG1Q02413 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
DSG1Q02413 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
DSG1Q02413 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
DSG1Q02413 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
DSG1Q02413 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
DSG1Q02413 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
DSG1Q02413 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
DSG1Q02413 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
DSG1Q02413 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
DSG1Q02413 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
DSG1Q02413 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
DSG1Q02413 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
DSG1Q02413 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
DSG1Q02413 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
DSG1Q02413 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
DSG1Q02413 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
DSG1Q02413 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
DSG1Q02413 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
DSG1Q02413 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
DSG1Q02413 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
DSG1Q02413 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
DSG1Q02413 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
DSG1Q02413 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
DSG1Q02413 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
DSG1Q02413 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
DSG1Q02413 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
DSG1Q02413 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
DSG1Q02413 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
DSG1Q02413 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
DSG1Q02413 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
DSG1Q02413 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
DSG1Q02413 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
DSG1Q02413 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
DSG1Q02413 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
DSG1Q02413 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
DSG1Q02413 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
DSG1Q02413 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
DSG1Q02413 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
DSG1Q02413 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC20.14■□□□□ 0.81
DSG1Q02413 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
DSG1Q02413 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
DSG1Q02413 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
DSG1Q02413 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
DSG1Q02413 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
DSG1Q02413 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
DSG1Q02413 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
DSG1Q02413 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
DSG1Q02413 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
DSG1Q02413 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
DSG1Q02413 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
DSG1Q02413 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
DSG1Q02413 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
DSG1Q02413 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
DSG1Q02413 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
DSG1Q02413 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
DSG1Q02413 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
DSG1Q02413 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
DSG1Q02413 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
DSG1Q02413 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
DSG1Q02413 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC20.13■□□□□ 0.81
DSG1Q02413 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
DSG1Q02413 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
DSG1Q02413 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
DSG1Q02413 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
DSG1Q02413 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
DSG1Q02413 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
DSG1Q02413 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
DSG1Q02413 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
DSG1Q02413 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
DSG1Q02413 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
DSG1Q02413 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
DSG1Q02413 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
DSG1Q02413 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
DSG1Q02413 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
DSG1Q02413 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
DSG1Q02413 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
DSG1Q02413 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
DSG1Q02413 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
DSG1Q02413 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
DSG1Q02413 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
DSG1Q02413 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
DSG1Q02413 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
DSG1Q02413 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
DSG1Q02413 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
DSG1Q02413 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
DSG1Q02413 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
DSG1Q02413 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
DSG1Q02413 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
DSG1Q02413 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
DSG1Q02413 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
DSG1Q02413 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
DSG1Q02413 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
DSG1Q02413 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
DSG1Q02413 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
DSG1Q02413 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
DSG1Q02413 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.7 ms