Protein–RNA interactions for Protein: Q01726

MC1R, Melanocyte-stimulating hormone receptor, humanhuman

Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MC1RQ01726 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
MC1RQ01726 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
MC1RQ01726 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
MC1RQ01726 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
MC1RQ01726 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
MC1RQ01726 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
MC1RQ01726 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
MC1RQ01726 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
MC1RQ01726 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
MC1RQ01726 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
MC1RQ01726 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
MC1RQ01726 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
MC1RQ01726 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
MC1RQ01726 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
MC1RQ01726 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
MC1RQ01726 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
MC1RQ01726 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
MC1RQ01726 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
MC1RQ01726 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
MC1RQ01726 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
MC1RQ01726 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
MC1RQ01726 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
MC1RQ01726 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
MC1RQ01726 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
MC1RQ01726 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
MC1RQ01726 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
MC1RQ01726 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
MC1RQ01726 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
MC1RQ01726 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
MC1RQ01726 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
MC1RQ01726 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
MC1RQ01726 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
MC1RQ01726 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
MC1RQ01726 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
MC1RQ01726 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
MC1RQ01726 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.28■□□□□ 0.52
MC1RQ01726 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
MC1RQ01726 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
MC1RQ01726 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
MC1RQ01726 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
MC1RQ01726 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
MC1RQ01726 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
MC1RQ01726 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
MC1RQ01726 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
MC1RQ01726 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
MC1RQ01726 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
MC1RQ01726 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
MC1RQ01726 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
MC1RQ01726 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
MC1RQ01726 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
MC1RQ01726 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
MC1RQ01726 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
MC1RQ01726 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
MC1RQ01726 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
MC1RQ01726 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
MC1RQ01726 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
MC1RQ01726 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
MC1RQ01726 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
MC1RQ01726 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
MC1RQ01726 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
MC1RQ01726 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
MC1RQ01726 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
MC1RQ01726 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
MC1RQ01726 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
MC1RQ01726 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
MC1RQ01726 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
MC1RQ01726 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
MC1RQ01726 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
MC1RQ01726 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
MC1RQ01726 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC18.26■□□□□ 0.51
MC1RQ01726 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
MC1RQ01726 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
MC1RQ01726 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
MC1RQ01726 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
MC1RQ01726 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
MC1RQ01726 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
MC1RQ01726 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
MC1RQ01726 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
MC1RQ01726 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
MC1RQ01726 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
MC1RQ01726 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
MC1RQ01726 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC18.26■□□□□ 0.51
MC1RQ01726 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
MC1RQ01726 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
MC1RQ01726 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
MC1RQ01726 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
MC1RQ01726 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
MC1RQ01726 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
MC1RQ01726 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
MC1RQ01726 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
MC1RQ01726 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
MC1RQ01726 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
MC1RQ01726 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
MC1RQ01726 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
MC1RQ01726 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
MC1RQ01726 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
MC1RQ01726 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
MC1RQ01726 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
MC1RQ01726 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
MC1RQ01726 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.7 ms