Protein–RNA interactions for Protein: Q00975

CACNA1B, Voltage-dependent N-type calcium channel subunit alpha-1B, humanhuman

Predictions only

Length 2,339 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA1BQ00975 AL662799.1-201ENST00000630418 496 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CACNA1BQ00975 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CACNA1BQ00975 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CACNA1BQ00975 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CACNA1BQ00975 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CACNA1BQ00975 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CACNA1BQ00975 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CACNA1BQ00975 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CACNA1BQ00975 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CACNA1BQ00975 FOXP3-206ENST00000557224 1371 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CACNA1BQ00975 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CACNA1BQ00975 NKAIN2-201ENST00000368416 1106 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CACNA1BQ00975 AC106897.1-201ENST00000512874 394 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CACNA1BQ00975 AC108449.3-201ENST00000560714 585 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CACNA1BQ00975 AC068594.1-203ENST00000581153 695 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CACNA1BQ00975 AC008761.1-201ENST00000595363 217 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CACNA1BQ00975 AC008735.5-201ENST00000623544 497 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
CACNA1BQ00975 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CACNA1BQ00975 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CACNA1BQ00975 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CACNA1BQ00975 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CACNA1BQ00975 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CACNA1BQ00975 GRAP-202ENST00000395635 834 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.38
CACNA1BQ00975 C6orf226-201ENST00000408925 552 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.38
CACNA1BQ00975 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.38
CACNA1BQ00975 AC019103.1-201ENST00000503095 272 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.38
CACNA1BQ00975 EEF1D-223ENST00000528610 923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
CACNA1BQ00975 EEF1D-238ENST00000531621 840 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.38
CACNA1BQ00975 AL078644.1-201ENST00000609881 752 ntBASIC17.39■□□□□ 0.38
CACNA1BQ00975 CECR7-204ENST00000609932 568 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.38
CACNA1BQ00975 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC17.39■□□□□ 0.38
CACNA1BQ00975 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
CACNA1BQ00975 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
CACNA1BQ00975 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CACNA1BQ00975 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CACNA1BQ00975 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
CACNA1BQ00975 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CACNA1BQ00975 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CACNA1BQ00975 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CACNA1BQ00975 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CACNA1BQ00975 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CACNA1BQ00975 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CACNA1BQ00975 ARHGAP11B-201ENST00000428041 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CACNA1BQ00975 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CACNA1BQ00975 AC106795.3-201ENST00000511650 547 ntTSL 4 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CACNA1BQ00975 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CACNA1BQ00975 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CACNA1BQ00975 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CACNA1BQ00975 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CACNA1BQ00975 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CACNA1BQ00975 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CACNA1BQ00975 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CACNA1BQ00975 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CACNA1BQ00975 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CACNA1BQ00975 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CACNA1BQ00975 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
CACNA1BQ00975 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
CACNA1BQ00975 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CACNA1BQ00975 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CACNA1BQ00975 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CACNA1BQ00975 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CACNA1BQ00975 UBE2G2-201ENST00000330942 721 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CACNA1BQ00975 AL139400.1-201ENST00000366220 510 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
CACNA1BQ00975 CD99-204ENST00000381187 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CACNA1BQ00975 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CACNA1BQ00975 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CACNA1BQ00975 SNHG15-207ENST00000582727 1039 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CACNA1BQ00975 HNRNPDL-210ENST00000630827 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CACNA1BQ00975 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CACNA1BQ00975 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CACNA1BQ00975 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CACNA1BQ00975 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CACNA1BQ00975 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CACNA1BQ00975 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CACNA1BQ00975 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CACNA1BQ00975 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
CACNA1BQ00975 AC002472.2-201ENST00000442739 958 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
CACNA1BQ00975 AC093214.1-201ENST00000511688 1107 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
CACNA1BQ00975 IGHV3-71-201ENST00000523324 359 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
CACNA1BQ00975 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CACNA1BQ00975 RNF34-208ENST00000555076 593 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CACNA1BQ00975 AC073592.5-201ENST00000624854 528 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
CACNA1BQ00975 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CACNA1BQ00975 ALDH2-202ENST00000416293 1572 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CACNA1BQ00975 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CACNA1BQ00975 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CACNA1BQ00975 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CACNA1BQ00975 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CACNA1BQ00975 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CACNA1BQ00975 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CACNA1BQ00975 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CACNA1BQ00975 VAMP4-202ENST00000367740 1193 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CACNA1BQ00975 HIST1H2BD-202ENST00000377777 496 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CACNA1BQ00975 IZUMO4-201ENST00000395296 869 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CACNA1BQ00975 AP001107.6-201ENST00000526655 516 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CACNA1BQ00975 EMC4-203ENST00000557879 1009 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CACNA1BQ00975 RN7SL204P-201ENST00000582831 262 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
CACNA1BQ00975 AC007192.2-201ENST00000600364 463 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CACNA1BQ00975 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
CACNA1BQ00975 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.8 ms