Protein–RNA interactions for Protein: Q00888

PSG4, Pregnancy-specific beta-1-glycoprotein 4, humanhuman

Predictions only

Length 419 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSG4Q00888 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PSG4Q00888 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
PSG4Q00888 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PSG4Q00888 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PSG4Q00888 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PSG4Q00888 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PSG4Q00888 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PSG4Q00888 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
PSG4Q00888 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
PSG4Q00888 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PSG4Q00888 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PSG4Q00888 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PSG4Q00888 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PSG4Q00888 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PSG4Q00888 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PSG4Q00888 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.22
PSG4Q00888 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.22
PSG4Q00888 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.22
PSG4Q00888 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PSG4Q00888 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PSG4Q00888 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PSG4Q00888 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PSG4Q00888 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PSG4Q00888 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PSG4Q00888 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PSG4Q00888 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PSG4Q00888 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PSG4Q00888 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
PSG4Q00888 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
PSG4Q00888 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
PSG4Q00888 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PSG4Q00888 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PSG4Q00888 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PSG4Q00888 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PSG4Q00888 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PSG4Q00888 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PSG4Q00888 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PSG4Q00888 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
PSG4Q00888 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
PSG4Q00888 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PSG4Q00888 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PSG4Q00888 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PSG4Q00888 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PSG4Q00888 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PSG4Q00888 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PSG4Q00888 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PSG4Q00888 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PSG4Q00888 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PSG4Q00888 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
PSG4Q00888 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PSG4Q00888 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PSG4Q00888 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PSG4Q00888 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PSG4Q00888 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PSG4Q00888 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PSG4Q00888 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PSG4Q00888 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PSG4Q00888 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PSG4Q00888 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PSG4Q00888 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PSG4Q00888 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PSG4Q00888 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
PSG4Q00888 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PSG4Q00888 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PSG4Q00888 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PSG4Q00888 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PSG4Q00888 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PSG4Q00888 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PSG4Q00888 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
PSG4Q00888 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PSG4Q00888 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
PSG4Q00888 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PSG4Q00888 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PSG4Q00888 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PSG4Q00888 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PSG4Q00888 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PSG4Q00888 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PSG4Q00888 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PSG4Q00888 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PSG4Q00888 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PSG4Q00888 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PSG4Q00888 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PSG4Q00888 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PSG4Q00888 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PSG4Q00888 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PSG4Q00888 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PSG4Q00888 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PSG4Q00888 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
PSG4Q00888 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PSG4Q00888 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PSG4Q00888 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PSG4Q00888 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PSG4Q00888 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PSG4Q00888 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PSG4Q00888 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PSG4Q00888 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PSG4Q00888 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PSG4Q00888 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PSG4Q00888 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PSG4Q00888 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.2 ms