Protein–RNA interactions for Protein: P78329

CYP4F2, Phylloquinone omega-hydroxylase CYP4F2, humanhuman

Predictions only

Length 520 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYP4F2P78329 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CYP4F2P78329 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CYP4F2P78329 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CYP4F2P78329 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CYP4F2P78329 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CYP4F2P78329 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CYP4F2P78329 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CYP4F2P78329 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CYP4F2P78329 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CYP4F2P78329 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CYP4F2P78329 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CYP4F2P78329 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CYP4F2P78329 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CYP4F2P78329 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CYP4F2P78329 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CYP4F2P78329 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CYP4F2P78329 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CYP4F2P78329 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CYP4F2P78329 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CYP4F2P78329 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CYP4F2P78329 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CYP4F2P78329 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
CYP4F2P78329 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
CYP4F2P78329 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
CYP4F2P78329 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CYP4F2P78329 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CYP4F2P78329 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CYP4F2P78329 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CYP4F2P78329 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CYP4F2P78329 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CYP4F2P78329 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CYP4F2P78329 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CYP4F2P78329 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CYP4F2P78329 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CYP4F2P78329 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CYP4F2P78329 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CYP4F2P78329 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CYP4F2P78329 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CYP4F2P78329 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
CYP4F2P78329 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CYP4F2P78329 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CYP4F2P78329 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CYP4F2P78329 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CYP4F2P78329 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
CYP4F2P78329 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
CYP4F2P78329 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
CYP4F2P78329 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CYP4F2P78329 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CYP4F2P78329 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CYP4F2P78329 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CYP4F2P78329 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CYP4F2P78329 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CYP4F2P78329 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
CYP4F2P78329 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
CYP4F2P78329 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CYP4F2P78329 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CYP4F2P78329 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CYP4F2P78329 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CYP4F2P78329 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CYP4F2P78329 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CYP4F2P78329 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CYP4F2P78329 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CYP4F2P78329 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CYP4F2P78329 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CYP4F2P78329 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CYP4F2P78329 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CYP4F2P78329 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CYP4F2P78329 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CYP4F2P78329 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CYP4F2P78329 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CYP4F2P78329 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CYP4F2P78329 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CYP4F2P78329 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CYP4F2P78329 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CYP4F2P78329 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CYP4F2P78329 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CYP4F2P78329 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CYP4F2P78329 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CYP4F2P78329 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CYP4F2P78329 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
CYP4F2P78329 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CYP4F2P78329 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CYP4F2P78329 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CYP4F2P78329 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CYP4F2P78329 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CYP4F2P78329 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CYP4F2P78329 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CYP4F2P78329 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CYP4F2P78329 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CYP4F2P78329 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CYP4F2P78329 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CYP4F2P78329 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CYP4F2P78329 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CYP4F2P78329 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CYP4F2P78329 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CYP4F2P78329 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CYP4F2P78329 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CYP4F2P78329 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CYP4F2P78329 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CYP4F2P78329 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.2 ms