Protein–RNA interactions for Protein: P63208

SKP1, S-phase kinase-associated protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 163 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKP1P63208 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SKP1P63208 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SKP1P63208 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SKP1P63208 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SKP1P63208 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SKP1P63208 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SKP1P63208 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SKP1P63208 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SKP1P63208 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
SKP1P63208 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SKP1P63208 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SKP1P63208 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SKP1P63208 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SKP1P63208 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SKP1P63208 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
SKP1P63208 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SKP1P63208 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SKP1P63208 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SKP1P63208 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SKP1P63208 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SKP1P63208 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SKP1P63208 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
SKP1P63208 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SKP1P63208 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SKP1P63208 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SKP1P63208 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SKP1P63208 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SKP1P63208 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SKP1P63208 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SKP1P63208 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
SKP1P63208 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SKP1P63208 KANK1-204ENST00000382293 5249 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SKP1P63208 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SKP1P63208 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SKP1P63208 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SKP1P63208 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SKP1P63208 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SKP1P63208 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SKP1P63208 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SKP1P63208 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SKP1P63208 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SKP1P63208 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SKP1P63208 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SKP1P63208 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
SKP1P63208 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
SKP1P63208 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SKP1P63208 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SKP1P63208 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SKP1P63208 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
SKP1P63208 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SKP1P63208 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
SKP1P63208 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
SKP1P63208 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
SKP1P63208 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SKP1P63208 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
SKP1P63208 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SKP1P63208 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
SKP1P63208 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SKP1P63208 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SKP1P63208 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
SKP1P63208 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SKP1P63208 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SKP1P63208 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SKP1P63208 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.46
SKP1P63208 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SKP1P63208 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SKP1P63208 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SKP1P63208 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SKP1P63208 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SKP1P63208 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SKP1P63208 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SKP1P63208 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
SKP1P63208 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SKP1P63208 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
SKP1P63208 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SKP1P63208 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SKP1P63208 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SKP1P63208 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SKP1P63208 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SKP1P63208 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SKP1P63208 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SKP1P63208 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SKP1P63208 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SKP1P63208 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SKP1P63208 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SKP1P63208 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SKP1P63208 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SKP1P63208 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SKP1P63208 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SKP1P63208 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SKP1P63208 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SKP1P63208 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SKP1P63208 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SKP1P63208 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SKP1P63208 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SKP1P63208 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SKP1P63208 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SKP1P63208 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SKP1P63208 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SKP1P63208 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.1 ms