Protein–RNA interactions for Protein: P62249

RPS16, 40S ribosomal protein S16, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 146 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS16P62249 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RPS16P62249 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RPS16P62249 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RPS16P62249 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RPS16P62249 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
RPS16P62249 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RPS16P62249 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RPS16P62249 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
RPS16P62249 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RPS16P62249 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RPS16P62249 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
RPS16P62249 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RPS16P62249 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RPS16P62249 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RPS16P62249 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RPS16P62249 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RPS16P62249 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RPS16P62249 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RPS16P62249 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RPS16P62249 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RPS16P62249 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RPS16P62249 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RPS16P62249 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RPS16P62249 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RPS16P62249 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RPS16P62249 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RPS16P62249 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RPS16P62249 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RPS16P62249 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RPS16P62249 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RPS16P62249 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RPS16P62249 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RPS16P62249 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RPS16P62249 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RPS16P62249 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RPS16P62249 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RPS16P62249 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RPS16P62249 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RPS16P62249 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RPS16P62249 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RPS16P62249 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
RPS16P62249 CAMK2D-201ENST00000296402 5820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RPS16P62249 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RPS16P62249 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RPS16P62249 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RPS16P62249 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RPS16P62249 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RPS16P62249 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RPS16P62249 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RPS16P62249 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RPS16P62249 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RPS16P62249 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RPS16P62249 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RPS16P62249 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RPS16P62249 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RPS16P62249 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RPS16P62249 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RPS16P62249 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RPS16P62249 WNK2-201ENST00000297954 7138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RPS16P62249 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
RPS16P62249 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
RPS16P62249 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
RPS16P62249 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
RPS16P62249 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
RPS16P62249 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
RPS16P62249 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
RPS16P62249 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
RPS16P62249 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
RPS16P62249 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
RPS16P62249 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
RPS16P62249 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
RPS16P62249 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
RPS16P62249 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
RPS16P62249 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
RPS16P62249 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
RPS16P62249 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC15.52■□□□□ 0.08
RPS16P62249 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
RPS16P62249 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC15.52■□□□□ 0.08
RPS16P62249 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
RPS16P62249 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
RPS16P62249 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
RPS16P62249 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
RPS16P62249 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
RPS16P62249 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
RPS16P62249 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
RPS16P62249 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
RPS16P62249 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
RPS16P62249 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.52■□□□□ 0.07
RPS16P62249 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RPS16P62249 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RPS16P62249 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RPS16P62249 CROCC2-201ENST00000443866 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RPS16P62249 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RPS16P62249 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RPS16P62249 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RPS16P62249 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RPS16P62249 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RPS16P62249 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RPS16P62249 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
RPS16P62249 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.4 ms