Protein–RNA interactions for Protein: P61204

ARF3, ADP-ribosylation factor 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 181 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARF3P61204 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
ARF3P61204 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
ARF3P61204 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ARF3P61204 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ARF3P61204 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ARF3P61204 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ARF3P61204 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ARF3P61204 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ARF3P61204 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ARF3P61204 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ARF3P61204 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ARF3P61204 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ARF3P61204 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ARF3P61204 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
ARF3P61204 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
ARF3P61204 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ARF3P61204 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ARF3P61204 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ARF3P61204 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ARF3P61204 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ARF3P61204 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ARF3P61204 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ARF3P61204 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ARF3P61204 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ARF3P61204 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ARF3P61204 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ARF3P61204 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ARF3P61204 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ARF3P61204 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ARF3P61204 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ARF3P61204 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ARF3P61204 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ARF3P61204 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ARF3P61204 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ARF3P61204 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ARF3P61204 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ARF3P61204 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ARF3P61204 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ARF3P61204 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ARF3P61204 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ARF3P61204 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
ARF3P61204 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ARF3P61204 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ARF3P61204 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ARF3P61204 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
ARF3P61204 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ARF3P61204 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ARF3P61204 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ARF3P61204 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ARF3P61204 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ARF3P61204 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ARF3P61204 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ARF3P61204 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ARF3P61204 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ARF3P61204 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ARF3P61204 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ARF3P61204 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ARF3P61204 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ARF3P61204 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ARF3P61204 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
ARF3P61204 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ARF3P61204 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ARF3P61204 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
ARF3P61204 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
ARF3P61204 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ARF3P61204 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ARF3P61204 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ARF3P61204 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
ARF3P61204 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ARF3P61204 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ARF3P61204 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
ARF3P61204 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
ARF3P61204 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ARF3P61204 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
ARF3P61204 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
ARF3P61204 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ARF3P61204 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ARF3P61204 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
ARF3P61204 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
ARF3P61204 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ARF3P61204 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
ARF3P61204 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
ARF3P61204 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ARF3P61204 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
ARF3P61204 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
ARF3P61204 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
ARF3P61204 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
ARF3P61204 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.46
ARF3P61204 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
ARF3P61204 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ARF3P61204 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ARF3P61204 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
ARF3P61204 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
ARF3P61204 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ARF3P61204 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ARF3P61204 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ARF3P61204 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ARF3P61204 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ARF3P61204 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ARF3P61204 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.2 ms