Protein–RNA interactions for Protein: P61088

UBE2N, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 N, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 152 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2NP61088 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
UBE2NP61088 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
UBE2NP61088 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
UBE2NP61088 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
UBE2NP61088 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
UBE2NP61088 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
UBE2NP61088 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
UBE2NP61088 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
UBE2NP61088 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
UBE2NP61088 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
UBE2NP61088 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
UBE2NP61088 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
UBE2NP61088 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
UBE2NP61088 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
UBE2NP61088 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
UBE2NP61088 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
UBE2NP61088 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
UBE2NP61088 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
UBE2NP61088 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
UBE2NP61088 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
UBE2NP61088 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
UBE2NP61088 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
UBE2NP61088 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
UBE2NP61088 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
UBE2NP61088 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
UBE2NP61088 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
UBE2NP61088 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
UBE2NP61088 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
UBE2NP61088 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
UBE2NP61088 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
UBE2NP61088 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
UBE2NP61088 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
UBE2NP61088 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
UBE2NP61088 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
UBE2NP61088 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
UBE2NP61088 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
UBE2NP61088 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
UBE2NP61088 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
UBE2NP61088 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
UBE2NP61088 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
UBE2NP61088 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
UBE2NP61088 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
UBE2NP61088 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
UBE2NP61088 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
UBE2NP61088 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
UBE2NP61088 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
UBE2NP61088 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
UBE2NP61088 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
UBE2NP61088 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
UBE2NP61088 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
UBE2NP61088 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
UBE2NP61088 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
UBE2NP61088 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
UBE2NP61088 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
UBE2NP61088 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
UBE2NP61088 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
UBE2NP61088 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
UBE2NP61088 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
UBE2NP61088 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
UBE2NP61088 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC16.57■□□□□ 0.24
UBE2NP61088 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
UBE2NP61088 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
UBE2NP61088 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
UBE2NP61088 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
UBE2NP61088 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
UBE2NP61088 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
UBE2NP61088 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
UBE2NP61088 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
UBE2NP61088 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
UBE2NP61088 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
UBE2NP61088 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
UBE2NP61088 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
UBE2NP61088 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
UBE2NP61088 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
UBE2NP61088 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
UBE2NP61088 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
UBE2NP61088 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
UBE2NP61088 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
UBE2NP61088 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
UBE2NP61088 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
UBE2NP61088 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
UBE2NP61088 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
UBE2NP61088 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
UBE2NP61088 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
UBE2NP61088 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
UBE2NP61088 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
UBE2NP61088 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
UBE2NP61088 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
UBE2NP61088 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
UBE2NP61088 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
UBE2NP61088 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
UBE2NP61088 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
UBE2NP61088 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
UBE2NP61088 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
UBE2NP61088 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
UBE2NP61088 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
UBE2NP61088 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
UBE2NP61088 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
UBE2NP61088 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
UBE2NP61088 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.8 ms