Protein–RNA interactions for Protein: P60880

SNAP25, Synaptosomal-associated protein 25, humanhuman

Predictions only

Length 206 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNAP25P60880 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SNAP25P60880 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SNAP25P60880 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SNAP25P60880 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SNAP25P60880 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SNAP25P60880 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SNAP25P60880 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SNAP25P60880 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SNAP25P60880 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SNAP25P60880 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SNAP25P60880 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SNAP25P60880 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SNAP25P60880 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SNAP25P60880 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SNAP25P60880 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SNAP25P60880 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SNAP25P60880 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SNAP25P60880 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SNAP25P60880 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SNAP25P60880 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SNAP25P60880 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SNAP25P60880 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SNAP25P60880 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SNAP25P60880 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SNAP25P60880 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SNAP25P60880 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SNAP25P60880 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SNAP25P60880 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SNAP25P60880 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SNAP25P60880 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SNAP25P60880 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SNAP25P60880 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SNAP25P60880 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SNAP25P60880 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SNAP25P60880 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SNAP25P60880 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SNAP25P60880 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
SNAP25P60880 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SNAP25P60880 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SNAP25P60880 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SNAP25P60880 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SNAP25P60880 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SNAP25P60880 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SNAP25P60880 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
SNAP25P60880 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
SNAP25P60880 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SNAP25P60880 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SNAP25P60880 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SNAP25P60880 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SNAP25P60880 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SNAP25P60880 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SNAP25P60880 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SNAP25P60880 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SNAP25P60880 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SNAP25P60880 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SNAP25P60880 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SNAP25P60880 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SNAP25P60880 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SNAP25P60880 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SNAP25P60880 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SNAP25P60880 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SNAP25P60880 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SNAP25P60880 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
SNAP25P60880 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SNAP25P60880 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SNAP25P60880 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SNAP25P60880 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SNAP25P60880 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SNAP25P60880 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SNAP25P60880 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
SNAP25P60880 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
SNAP25P60880 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
SNAP25P60880 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SNAP25P60880 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SNAP25P60880 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SNAP25P60880 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SNAP25P60880 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
SNAP25P60880 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SNAP25P60880 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SNAP25P60880 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SNAP25P60880 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SNAP25P60880 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
SNAP25P60880 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SNAP25P60880 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SNAP25P60880 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SNAP25P60880 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SNAP25P60880 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SNAP25P60880 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SNAP25P60880 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SNAP25P60880 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SNAP25P60880 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SNAP25P60880 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SNAP25P60880 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SNAP25P60880 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SNAP25P60880 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SNAP25P60880 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SNAP25P60880 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SNAP25P60880 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SNAP25P60880 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SNAP25P60880 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73.9 ms