Protein–RNA interactions for Protein: P60509

ERVPABLB-1, Endogenous retrovirus group PABLB member 1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 514 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVPABLB-1P60509 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
ERVPABLB-1P60509 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
ERVPABLB-1P60509 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
ERVPABLB-1P60509 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.67■□□□□ 0.58
ERVPABLB-1P60509 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
ERVPABLB-1P60509 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
ERVPABLB-1P60509 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC18.67■□□□□ 0.58
ERVPABLB-1P60509 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
ERVPABLB-1P60509 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
ERVPABLB-1P60509 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
ERVPABLB-1P60509 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
ERVPABLB-1P60509 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
ERVPABLB-1P60509 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
ERVPABLB-1P60509 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
ERVPABLB-1P60509 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
ERVPABLB-1P60509 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
ERVPABLB-1P60509 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
ERVPABLB-1P60509 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
ERVPABLB-1P60509 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
ERVPABLB-1P60509 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
ERVPABLB-1P60509 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
ERVPABLB-1P60509 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
ERVPABLB-1P60509 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
ERVPABLB-1P60509 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
ERVPABLB-1P60509 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
ERVPABLB-1P60509 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
ERVPABLB-1P60509 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
ERVPABLB-1P60509 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
ERVPABLB-1P60509 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
ERVPABLB-1P60509 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
ERVPABLB-1P60509 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
ERVPABLB-1P60509 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
ERVPABLB-1P60509 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
ERVPABLB-1P60509 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
ERVPABLB-1P60509 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
ERVPABLB-1P60509 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
ERVPABLB-1P60509 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
ERVPABLB-1P60509 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
ERVPABLB-1P60509 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
ERVPABLB-1P60509 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
ERVPABLB-1P60509 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
ERVPABLB-1P60509 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
ERVPABLB-1P60509 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC18.66■□□□□ 0.58
ERVPABLB-1P60509 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
ERVPABLB-1P60509 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
ERVPABLB-1P60509 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
ERVPABLB-1P60509 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
ERVPABLB-1P60509 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
ERVPABLB-1P60509 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
ERVPABLB-1P60509 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC18.66■□□□□ 0.58
ERVPABLB-1P60509 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
ERVPABLB-1P60509 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
ERVPABLB-1P60509 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
ERVPABLB-1P60509 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
ERVPABLB-1P60509 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
ERVPABLB-1P60509 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
ERVPABLB-1P60509 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
ERVPABLB-1P60509 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
ERVPABLB-1P60509 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
ERVPABLB-1P60509 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
ERVPABLB-1P60509 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
ERVPABLB-1P60509 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
ERVPABLB-1P60509 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
ERVPABLB-1P60509 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
ERVPABLB-1P60509 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC18.65■□□□□ 0.58
ERVPABLB-1P60509 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
ERVPABLB-1P60509 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
ERVPABLB-1P60509 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
ERVPABLB-1P60509 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
ERVPABLB-1P60509 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
ERVPABLB-1P60509 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
ERVPABLB-1P60509 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
ERVPABLB-1P60509 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
ERVPABLB-1P60509 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
ERVPABLB-1P60509 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
ERVPABLB-1P60509 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
ERVPABLB-1P60509 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
ERVPABLB-1P60509 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
ERVPABLB-1P60509 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC18.65■□□□□ 0.58
ERVPABLB-1P60509 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
ERVPABLB-1P60509 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC18.65■□□□□ 0.58
ERVPABLB-1P60509 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
ERVPABLB-1P60509 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
ERVPABLB-1P60509 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
ERVPABLB-1P60509 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
ERVPABLB-1P60509 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
ERVPABLB-1P60509 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
ERVPABLB-1P60509 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
ERVPABLB-1P60509 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
ERVPABLB-1P60509 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
ERVPABLB-1P60509 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
ERVPABLB-1P60509 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
ERVPABLB-1P60509 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
ERVPABLB-1P60509 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
ERVPABLB-1P60509 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
ERVPABLB-1P60509 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
ERVPABLB-1P60509 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.58
ERVPABLB-1P60509 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.58
ERVPABLB-1P60509 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
ERVPABLB-1P60509 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.6 ms