Protein–RNA interactions for Protein: P59044

NLRP6, NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 892 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NLRP6P59044 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
NLRP6P59044 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
NLRP6P59044 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
NLRP6P59044 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
NLRP6P59044 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
NLRP6P59044 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
NLRP6P59044 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
NLRP6P59044 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
NLRP6P59044 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
NLRP6P59044 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
NLRP6P59044 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
NLRP6P59044 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
NLRP6P59044 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
NLRP6P59044 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
NLRP6P59044 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
NLRP6P59044 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
NLRP6P59044 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
NLRP6P59044 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
NLRP6P59044 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
NLRP6P59044 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
NLRP6P59044 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
NLRP6P59044 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
NLRP6P59044 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
NLRP6P59044 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
NLRP6P59044 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
NLRP6P59044 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
NLRP6P59044 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
NLRP6P59044 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
NLRP6P59044 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
NLRP6P59044 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
NLRP6P59044 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
NLRP6P59044 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
NLRP6P59044 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
NLRP6P59044 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
NLRP6P59044 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
NLRP6P59044 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
NLRP6P59044 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
NLRP6P59044 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
NLRP6P59044 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
NLRP6P59044 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
NLRP6P59044 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
NLRP6P59044 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
NLRP6P59044 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
NLRP6P59044 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
NLRP6P59044 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
NLRP6P59044 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
NLRP6P59044 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
NLRP6P59044 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
NLRP6P59044 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
NLRP6P59044 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
NLRP6P59044 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
NLRP6P59044 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
NLRP6P59044 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
NLRP6P59044 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
NLRP6P59044 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
NLRP6P59044 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
NLRP6P59044 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
NLRP6P59044 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
NLRP6P59044 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
NLRP6P59044 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
NLRP6P59044 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
NLRP6P59044 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
NLRP6P59044 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
NLRP6P59044 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
NLRP6P59044 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
NLRP6P59044 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
NLRP6P59044 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
NLRP6P59044 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
NLRP6P59044 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
NLRP6P59044 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
NLRP6P59044 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
NLRP6P59044 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
NLRP6P59044 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC25.35■■□□□ 1.65
NLRP6P59044 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
NLRP6P59044 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
NLRP6P59044 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
NLRP6P59044 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
NLRP6P59044 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
NLRP6P59044 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
NLRP6P59044 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
NLRP6P59044 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
NLRP6P59044 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
NLRP6P59044 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
NLRP6P59044 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
NLRP6P59044 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
NLRP6P59044 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
NLRP6P59044 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
NLRP6P59044 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
NLRP6P59044 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
NLRP6P59044 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
NLRP6P59044 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
NLRP6P59044 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
NLRP6P59044 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
NLRP6P59044 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
NLRP6P59044 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
NLRP6P59044 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
NLRP6P59044 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
NLRP6P59044 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
NLRP6P59044 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
NLRP6P59044 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.7 ms