Protein–RNA interactions for Protein: P58304

VSX2, Visual system homeobox 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 361 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VSX2P58304 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
VSX2P58304 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
VSX2P58304 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
VSX2P58304 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
VSX2P58304 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
VSX2P58304 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
VSX2P58304 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
VSX2P58304 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
VSX2P58304 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
VSX2P58304 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
VSX2P58304 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
VSX2P58304 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
VSX2P58304 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
VSX2P58304 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
VSX2P58304 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
VSX2P58304 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
VSX2P58304 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
VSX2P58304 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
VSX2P58304 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
VSX2P58304 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
VSX2P58304 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
VSX2P58304 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
VSX2P58304 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
VSX2P58304 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
VSX2P58304 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
VSX2P58304 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
VSX2P58304 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
VSX2P58304 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
VSX2P58304 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
VSX2P58304 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC18.03■□□□□ 0.48
VSX2P58304 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
VSX2P58304 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
VSX2P58304 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
VSX2P58304 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
VSX2P58304 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
VSX2P58304 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
VSX2P58304 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
VSX2P58304 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
VSX2P58304 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
VSX2P58304 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
VSX2P58304 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
VSX2P58304 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
VSX2P58304 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
VSX2P58304 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
VSX2P58304 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
VSX2P58304 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
VSX2P58304 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
VSX2P58304 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
VSX2P58304 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
VSX2P58304 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
VSX2P58304 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
VSX2P58304 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
VSX2P58304 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
VSX2P58304 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
VSX2P58304 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
VSX2P58304 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
VSX2P58304 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
VSX2P58304 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
VSX2P58304 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
VSX2P58304 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.47
VSX2P58304 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
VSX2P58304 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
VSX2P58304 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
VSX2P58304 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
VSX2P58304 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
VSX2P58304 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
VSX2P58304 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
VSX2P58304 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
VSX2P58304 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
VSX2P58304 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
VSX2P58304 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
VSX2P58304 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
VSX2P58304 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
VSX2P58304 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
VSX2P58304 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
VSX2P58304 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
VSX2P58304 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
VSX2P58304 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
VSX2P58304 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
VSX2P58304 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
VSX2P58304 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
VSX2P58304 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
VSX2P58304 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
VSX2P58304 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
VSX2P58304 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
VSX2P58304 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
VSX2P58304 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
VSX2P58304 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
VSX2P58304 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
VSX2P58304 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
VSX2P58304 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
VSX2P58304 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
VSX2P58304 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
VSX2P58304 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
VSX2P58304 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
VSX2P58304 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
VSX2P58304 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
VSX2P58304 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
VSX2P58304 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
VSX2P58304 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.3 ms