Protein–RNA interactions for Protein: P57775

FBXW4, F-box/WD repeat-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 412 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FBXW4P57775 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
FBXW4P57775 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
FBXW4P57775 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
FBXW4P57775 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
FBXW4P57775 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
FBXW4P57775 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
FBXW4P57775 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
FBXW4P57775 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
FBXW4P57775 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
FBXW4P57775 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
FBXW4P57775 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
FBXW4P57775 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
FBXW4P57775 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
FBXW4P57775 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
FBXW4P57775 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
FBXW4P57775 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
FBXW4P57775 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
FBXW4P57775 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
FBXW4P57775 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
FBXW4P57775 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
FBXW4P57775 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
FBXW4P57775 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
FBXW4P57775 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
FBXW4P57775 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
FBXW4P57775 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
FBXW4P57775 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
FBXW4P57775 ZNF324-203ENST00000536459 5653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
FBXW4P57775 ZMIZ1-201ENST00000334512 7546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
FBXW4P57775 SENP6-205ENST00000447266 6501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
FBXW4P57775 LARP4B-211ENST00000612396 8546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
FBXW4P57775 FO681492.1-201ENST00000623662 5321 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
FBXW4P57775 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
FBXW4P57775 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
FBXW4P57775 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
FBXW4P57775 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
FBXW4P57775 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
FBXW4P57775 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
FBXW4P57775 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
FBXW4P57775 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
FBXW4P57775 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
FBXW4P57775 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
FBXW4P57775 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
FBXW4P57775 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
FBXW4P57775 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
FBXW4P57775 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
FBXW4P57775 KDM4B-201ENST00000159111 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
FBXW4P57775 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
FBXW4P57775 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
FBXW4P57775 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
FBXW4P57775 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
FBXW4P57775 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
FBXW4P57775 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
FBXW4P57775 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
FBXW4P57775 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
FBXW4P57775 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
FBXW4P57775 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
FBXW4P57775 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
FBXW4P57775 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
FBXW4P57775 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
FBXW4P57775 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
FBXW4P57775 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
FBXW4P57775 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
FBXW4P57775 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
FBXW4P57775 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
FBXW4P57775 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
FBXW4P57775 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
FBXW4P57775 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
FBXW4P57775 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
FBXW4P57775 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
FBXW4P57775 PEG3-206ENST00000598410 5304 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
FBXW4P57775 EIF4G3-212ENST00000602326 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
FBXW4P57775 ARHGEF40-201ENST00000298694 5919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
FBXW4P57775 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
FBXW4P57775 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
FBXW4P57775 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
FBXW4P57775 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
FBXW4P57775 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
FBXW4P57775 COL4A3BP-203ENST00000380494 5651 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
FBXW4P57775 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
FBXW4P57775 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.41
FBXW4P57775 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
FBXW4P57775 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
FBXW4P57775 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
FBXW4P57775 LINC00094-205ENST00000603928 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
FBXW4P57775 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
FBXW4P57775 PLCB2-201ENST00000260402 4616 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
FBXW4P57775 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
FBXW4P57775 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
FBXW4P57775 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
FBXW4P57775 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
FBXW4P57775 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
FBXW4P57775 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
FBXW4P57775 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
FBXW4P57775 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
FBXW4P57775 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
FBXW4P57775 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
FBXW4P57775 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
FBXW4P57775 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
FBXW4P57775 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
FBXW4P57775 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.1 ms