Protein–RNA interactions for Protein: P57723

PCBP4, Poly(rC)-binding protein 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 403 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCBP4P57723 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PCBP4P57723 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PCBP4P57723 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PCBP4P57723 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PCBP4P57723 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PCBP4P57723 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PCBP4P57723 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PCBP4P57723 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PCBP4P57723 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PCBP4P57723 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PCBP4P57723 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PCBP4P57723 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PCBP4P57723 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PCBP4P57723 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
PCBP4P57723 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PCBP4P57723 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PCBP4P57723 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PCBP4P57723 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PCBP4P57723 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PCBP4P57723 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PCBP4P57723 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PCBP4P57723 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
PCBP4P57723 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PCBP4P57723 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
PCBP4P57723 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PCBP4P57723 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PCBP4P57723 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PCBP4P57723 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PCBP4P57723 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PCBP4P57723 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PCBP4P57723 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
PCBP4P57723 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
PCBP4P57723 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
PCBP4P57723 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
PCBP4P57723 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
PCBP4P57723 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
PCBP4P57723 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
PCBP4P57723 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
PCBP4P57723 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PCBP4P57723 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PCBP4P57723 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PCBP4P57723 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PCBP4P57723 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PCBP4P57723 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PCBP4P57723 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PCBP4P57723 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PCBP4P57723 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PCBP4P57723 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PCBP4P57723 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PCBP4P57723 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PCBP4P57723 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PCBP4P57723 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PCBP4P57723 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PCBP4P57723 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PCBP4P57723 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PCBP4P57723 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PCBP4P57723 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PCBP4P57723 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PCBP4P57723 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PCBP4P57723 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PCBP4P57723 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PCBP4P57723 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PCBP4P57723 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
PCBP4P57723 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PCBP4P57723 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
PCBP4P57723 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PCBP4P57723 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PCBP4P57723 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PCBP4P57723 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PCBP4P57723 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PCBP4P57723 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PCBP4P57723 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PCBP4P57723 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PCBP4P57723 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PCBP4P57723 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PCBP4P57723 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PCBP4P57723 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PCBP4P57723 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PCBP4P57723 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PCBP4P57723 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PCBP4P57723 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PCBP4P57723 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PCBP4P57723 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PCBP4P57723 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PCBP4P57723 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PCBP4P57723 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
PCBP4P57723 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
PCBP4P57723 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PCBP4P57723 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PCBP4P57723 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PCBP4P57723 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PCBP4P57723 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PCBP4P57723 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PCBP4P57723 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PCBP4P57723 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PCBP4P57723 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PCBP4P57723 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PCBP4P57723 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PCBP4P57723 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PCBP4P57723 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.2 ms