Protein–RNA interactions for Protein: P55211

CASP9, Caspase-9, humanhuman

Predictions only

Length 416 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP9P55211 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CASP9P55211 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CASP9P55211 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CASP9P55211 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CASP9P55211 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
CASP9P55211 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
CASP9P55211 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
CASP9P55211 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
CASP9P55211 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
CASP9P55211 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
CASP9P55211 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
CASP9P55211 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
CASP9P55211 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CASP9P55211 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CASP9P55211 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CASP9P55211 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CASP9P55211 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CASP9P55211 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CASP9P55211 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CASP9P55211 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CASP9P55211 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CASP9P55211 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CASP9P55211 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
CASP9P55211 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CASP9P55211 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CASP9P55211 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CASP9P55211 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CASP9P55211 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CASP9P55211 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CASP9P55211 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CASP9P55211 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
CASP9P55211 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CASP9P55211 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CASP9P55211 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CASP9P55211 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CASP9P55211 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CASP9P55211 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CASP9P55211 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CASP9P55211 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CASP9P55211 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CASP9P55211 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CASP9P55211 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
CASP9P55211 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CASP9P55211 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CASP9P55211 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CASP9P55211 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
CASP9P55211 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CASP9P55211 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CASP9P55211 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CASP9P55211 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CASP9P55211 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CASP9P55211 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
CASP9P55211 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CASP9P55211 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CASP9P55211 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CASP9P55211 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CASP9P55211 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CASP9P55211 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CASP9P55211 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CASP9P55211 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CASP9P55211 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CASP9P55211 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CASP9P55211 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CASP9P55211 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CASP9P55211 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CASP9P55211 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CASP9P55211 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CASP9P55211 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CASP9P55211 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CASP9P55211 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CASP9P55211 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CASP9P55211 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CASP9P55211 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CASP9P55211 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CASP9P55211 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CASP9P55211 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CASP9P55211 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CASP9P55211 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
CASP9P55211 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CASP9P55211 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CASP9P55211 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CASP9P55211 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CASP9P55211 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CASP9P55211 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
CASP9P55211 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CASP9P55211 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CASP9P55211 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CASP9P55211 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CASP9P55211 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CASP9P55211 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CASP9P55211 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CASP9P55211 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CASP9P55211 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CASP9P55211 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CASP9P55211 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CASP9P55211 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CASP9P55211 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CASP9P55211 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CASP9P55211 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CASP9P55211 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.5 ms