Protein–RNA interactions for Protein: P55199

ELL, RNA polymerase II elongation factor ELL, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 621 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ELLP55199 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ELLP55199 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ELLP55199 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ELLP55199 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ELLP55199 UCHL5-206ENST00000367455 5327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ELLP55199 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ELLP55199 KDM6A-212ENST00000543216 5655 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ELLP55199 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ELLP55199 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ELLP55199 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ELLP55199 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ELLP55199 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ELLP55199 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ELLP55199 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ELLP55199 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
ELLP55199 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ELLP55199 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ELLP55199 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ELLP55199 CACNA1H-206ENST00000565831 7815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ELLP55199 ZBTB10-202ENST00000426744 9878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ELLP55199 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ELLP55199 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ELLP55199 L2HGDH-202ENST00000267436 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ELLP55199 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ELLP55199 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ELLP55199 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ELLP55199 KIF16B-201ENST00000354981 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ELLP55199 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ELLP55199 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ELLP55199 BEND4-202ENST00000504360 8692 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ELLP55199 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ELLP55199 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
ELLP55199 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.05
ELLP55199 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.05
ELLP55199 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
ELLP55199 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
ELLP55199 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
ELLP55199 NTRK2-206ENST00000376213 5560 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ELLP55199 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ELLP55199 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ELLP55199 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ELLP55199 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ELLP55199 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ELLP55199 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ELLP55199 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ELLP55199 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ELLP55199 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ELLP55199 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ELLP55199 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ELLP55199 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ELLP55199 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ELLP55199 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ELLP55199 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ELLP55199 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ELLP55199 ASB6-203ENST00000450050 4535 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ELLP55199 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ELLP55199 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ELLP55199 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ELLP55199 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ELLP55199 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ELLP55199 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ELLP55199 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ELLP55199 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ELLP55199 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ELLP55199 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ELLP55199 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ELLP55199 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ELLP55199 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ELLP55199 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ELLP55199 ENC1-205ENST00000510316 5381 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ELLP55199 FER1L4-210ENST00000615531 5998 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
ELLP55199 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ELLP55199 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ELLP55199 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ELLP55199 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ELLP55199 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ELLP55199 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ELLP55199 KDM4B-201ENST00000159111 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ELLP55199 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ELLP55199 KCMF1-201ENST00000409785 7568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ELLP55199 KCNMA1-261ENST00000639486 8850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ELLP55199 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ELLP55199 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
ELLP55199 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ELLP55199 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ELLP55199 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ELLP55199 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ELLP55199 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ELLP55199 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ELLP55199 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ELLP55199 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ELLP55199 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ELLP55199 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ELLP55199 LRRC3-201ENST00000291592 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ELLP55199 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ELLP55199 ZNF804A-201ENST00000302277 4690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ELLP55199 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ELLP55199 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ELLP55199 TRIL-201ENST00000539664 4935 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ELLP55199 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.3 ms