Protein–RNA interactions for Protein: P54707

ATP12A, Potassium-transporting ATPase alpha chain 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,039 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP12AP54707 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
ATP12AP54707 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
ATP12AP54707 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
ATP12AP54707 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
ATP12AP54707 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
ATP12AP54707 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
ATP12AP54707 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
ATP12AP54707 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
ATP12AP54707 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
ATP12AP54707 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
ATP12AP54707 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
ATP12AP54707 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
ATP12AP54707 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
ATP12AP54707 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
ATP12AP54707 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
ATP12AP54707 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
ATP12AP54707 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
ATP12AP54707 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
ATP12AP54707 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
ATP12AP54707 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
ATP12AP54707 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
ATP12AP54707 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
ATP12AP54707 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
ATP12AP54707 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
ATP12AP54707 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
ATP12AP54707 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ATP12AP54707 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ATP12AP54707 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ATP12AP54707 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
ATP12AP54707 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ATP12AP54707 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ATP12AP54707 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
ATP12AP54707 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC17.6■□□□□ 0.41
ATP12AP54707 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
ATP12AP54707 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
ATP12AP54707 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
ATP12AP54707 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ATP12AP54707 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ATP12AP54707 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
ATP12AP54707 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
ATP12AP54707 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ATP12AP54707 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
ATP12AP54707 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
ATP12AP54707 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ATP12AP54707 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
ATP12AP54707 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ATP12AP54707 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
ATP12AP54707 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ATP12AP54707 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ATP12AP54707 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ATP12AP54707 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ATP12AP54707 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
ATP12AP54707 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
ATP12AP54707 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ATP12AP54707 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
ATP12AP54707 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
ATP12AP54707 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ATP12AP54707 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ATP12AP54707 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
ATP12AP54707 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ATP12AP54707 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ATP12AP54707 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ATP12AP54707 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
ATP12AP54707 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
ATP12AP54707 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ATP12AP54707 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ATP12AP54707 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ATP12AP54707 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ATP12AP54707 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
ATP12AP54707 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ATP12AP54707 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC17.59■□□□□ 0.41
ATP12AP54707 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
ATP12AP54707 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
ATP12AP54707 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
ATP12AP54707 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ATP12AP54707 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ATP12AP54707 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ATP12AP54707 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC17.59■□□□□ 0.41
ATP12AP54707 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ATP12AP54707 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ATP12AP54707 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ATP12AP54707 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ATP12AP54707 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ATP12AP54707 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ATP12AP54707 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
ATP12AP54707 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
ATP12AP54707 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
ATP12AP54707 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC17.58■□□□□ 0.41
ATP12AP54707 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
ATP12AP54707 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
ATP12AP54707 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
ATP12AP54707 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
ATP12AP54707 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
ATP12AP54707 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
ATP12AP54707 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
ATP12AP54707 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
ATP12AP54707 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
ATP12AP54707 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
ATP12AP54707 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
ATP12AP54707 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.3 ms