Protein–RNA interactions for Protein: P54198

HIRA, Protein HIRA, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,017 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIRAP54198 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
HIRAP54198 SLC9A3R1-202ENST00000413388 1285 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
HIRAP54198 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
HIRAP54198 PITPNA-AS1-201ENST00000425081 542 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
HIRAP54198 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
HIRAP54198 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
HIRAP54198 HEXA-210ENST00000567213 1000 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
HIRAP54198 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
HIRAP54198 AC068594.1-202ENST00000581657 749 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
HIRAP54198 AC107896.1-201ENST00000593212 548 ntTSL 4 BASIC22.34■■□□□ 1.17
HIRAP54198 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
HIRAP54198 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
HIRAP54198 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
HIRAP54198 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
HIRAP54198 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
HIRAP54198 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
HIRAP54198 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
HIRAP54198 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
HIRAP54198 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
HIRAP54198 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
HIRAP54198 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
HIRAP54198 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
HIRAP54198 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
HIRAP54198 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
HIRAP54198 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
HIRAP54198 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
HIRAP54198 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
HIRAP54198 POLD2P1-201ENST00000511220 997 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
HIRAP54198 L2HGDH-205ENST00000555423 841 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
HIRAP54198 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
HIRAP54198 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
HIRAP54198 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
HIRAP54198 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
HIRAP54198 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
HIRAP54198 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
HIRAP54198 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
HIRAP54198 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
HIRAP54198 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
HIRAP54198 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
HIRAP54198 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
HIRAP54198 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
HIRAP54198 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
HIRAP54198 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
HIRAP54198 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
HIRAP54198 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
HIRAP54198 AL031284.1-201ENST00000419297 478 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
HIRAP54198 AL365226.1-201ENST00000448363 349 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
HIRAP54198 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
HIRAP54198 KRT18P58-201ENST00000527480 1120 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
HIRAP54198 AC092865.5-201ENST00000545435 363 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
HIRAP54198 KRT73-AS1-202ENST00000551089 563 ntTSL 4 BASIC22.32■■□□□ 1.16
HIRAP54198 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
HIRAP54198 MIEN1-205ENST00000577810 806 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
HIRAP54198 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
HIRAP54198 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
HIRAP54198 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
HIRAP54198 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
HIRAP54198 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
HIRAP54198 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
HIRAP54198 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
HIRAP54198 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
HIRAP54198 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
HIRAP54198 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
HIRAP54198 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
HIRAP54198 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
HIRAP54198 AC106730.1-201ENST00000566722 1090 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
HIRAP54198 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
HIRAP54198 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
HIRAP54198 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
HIRAP54198 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
HIRAP54198 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
HIRAP54198 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
HIRAP54198 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
HIRAP54198 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
HIRAP54198 AC243591.1-201ENST00000452967 1364 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
HIRAP54198 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
HIRAP54198 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
HIRAP54198 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
HIRAP54198 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
HIRAP54198 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
HIRAP54198 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
HIRAP54198 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
HIRAP54198 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
HIRAP54198 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
HIRAP54198 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
HIRAP54198 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
HIRAP54198 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
HIRAP54198 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
HIRAP54198 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
HIRAP54198 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
HIRAP54198 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
HIRAP54198 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
HIRAP54198 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
HIRAP54198 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
HIRAP54198 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
HIRAP54198 NDUFB2-209ENST00000472695 503 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
HIRAP54198 NCAM1-AS1-202ENST00000533638 618 ntTSL 4 BASIC22.29■■□□□ 1.16
HIRAP54198 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
HIRAP54198 AC011530.1-201ENST00000593999 558 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
HIRAP54198 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20 ms