Protein–RNA interactions for Protein: P50548

ERF, ETS domain-containing transcription factor ERF, humanhuman

Predictions only

Length 548 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERFP50548 MAPKAP1-208ENST00000394063 2977 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.5
ERFP50548 AC084018.2-201ENST00000613093 2607 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
ERFP50548 INPP5B-201ENST00000373021 3934 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ERFP50548 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ERFP50548 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ERFP50548 MAGI3-201ENST00000307546 6430 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ERFP50548 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ERFP50548 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ERFP50548 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ERFP50548 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ERFP50548 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ERFP50548 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ERFP50548 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ERFP50548 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ERFP50548 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ERFP50548 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ERFP50548 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ERFP50548 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ERFP50548 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ERFP50548 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ERFP50548 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ERFP50548 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ERFP50548 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ERFP50548 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ERFP50548 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ERFP50548 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ERFP50548 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ERFP50548 KAZN-201ENST00000361144 3838 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ERFP50548 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
ERFP50548 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
ERFP50548 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ERFP50548 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ERFP50548 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ERFP50548 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ERFP50548 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ERFP50548 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ERFP50548 GLDC-201ENST00000321612 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ERFP50548 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ERFP50548 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ERFP50548 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ERFP50548 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ERFP50548 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ERFP50548 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ERFP50548 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ERFP50548 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ERFP50548 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ERFP50548 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ERFP50548 TPBG-203ENST00000543496 2881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ERFP50548 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ERFP50548 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ERFP50548 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ERFP50548 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ERFP50548 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ERFP50548 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ERFP50548 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ERFP50548 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ERFP50548 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ERFP50548 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ERFP50548 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ERFP50548 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ERFP50548 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ERFP50548 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ERFP50548 ITSN2-201ENST00000355123 6300 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ERFP50548 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ERFP50548 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ERFP50548 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ERFP50548 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ERFP50548 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ERFP50548 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ERFP50548 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ERFP50548 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ERFP50548 STAT5A-207ENST00000546010 3086 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ERFP50548 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ERFP50548 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
ERFP50548 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
ERFP50548 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ERFP50548 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ERFP50548 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ERFP50548 CENPT-208ENST00000562787 2345 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ERFP50548 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ERFP50548 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ERFP50548 SGPP1-201ENST00000247225 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ERFP50548 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ERFP50548 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ERFP50548 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ERFP50548 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ERFP50548 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ERFP50548 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ERFP50548 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ERFP50548 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ERFP50548 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ERFP50548 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
ERFP50548 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ERFP50548 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ERFP50548 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ERFP50548 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ERFP50548 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ERFP50548 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ERFP50548 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ERFP50548 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.2 ms