Protein–RNA interactions for Protein: P49959

MRE11, Double-strand break repair protein MRE11, humanhuman

Predictions only

Length 708 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MRE11P49959 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
MRE11P49959 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
MRE11P49959 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
MRE11P49959 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
MRE11P49959 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
MRE11P49959 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
MRE11P49959 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
MRE11P49959 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
MRE11P49959 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
MRE11P49959 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
MRE11P49959 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
MRE11P49959 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
MRE11P49959 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
MRE11P49959 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
MRE11P49959 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
MRE11P49959 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
MRE11P49959 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
MRE11P49959 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
MRE11P49959 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
MRE11P49959 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
MRE11P49959 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
MRE11P49959 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
MRE11P49959 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
MRE11P49959 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
MRE11P49959 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
MRE11P49959 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
MRE11P49959 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
MRE11P49959 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
MRE11P49959 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
MRE11P49959 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
MRE11P49959 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
MRE11P49959 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
MRE11P49959 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
MRE11P49959 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
MRE11P49959 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
MRE11P49959 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
MRE11P49959 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
MRE11P49959 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
MRE11P49959 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
MRE11P49959 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
MRE11P49959 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
MRE11P49959 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
MRE11P49959 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
MRE11P49959 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
MRE11P49959 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
MRE11P49959 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
MRE11P49959 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
MRE11P49959 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC21.91■■□□□ 1.1
MRE11P49959 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
MRE11P49959 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
MRE11P49959 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
MRE11P49959 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
MRE11P49959 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
MRE11P49959 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
MRE11P49959 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
MRE11P49959 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
MRE11P49959 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
MRE11P49959 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
MRE11P49959 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
MRE11P49959 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
MRE11P49959 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
MRE11P49959 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
MRE11P49959 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
MRE11P49959 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
MRE11P49959 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
MRE11P49959 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
MRE11P49959 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
MRE11P49959 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
MRE11P49959 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
MRE11P49959 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
MRE11P49959 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
MRE11P49959 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
MRE11P49959 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
MRE11P49959 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
MRE11P49959 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
MRE11P49959 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
MRE11P49959 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
MRE11P49959 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
MRE11P49959 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
MRE11P49959 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
MRE11P49959 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
MRE11P49959 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC21.9■■□□□ 1.1
MRE11P49959 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
MRE11P49959 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
MRE11P49959 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
MRE11P49959 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
MRE11P49959 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
MRE11P49959 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
MRE11P49959 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
MRE11P49959 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
MRE11P49959 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
MRE11P49959 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
MRE11P49959 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
MRE11P49959 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
MRE11P49959 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
MRE11P49959 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
MRE11P49959 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.1
MRE11P49959 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
MRE11P49959 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
MRE11P49959 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.7 ms