Protein–RNA interactions for Protein: P49336

CDK8, Cyclin-dependent kinase 8, humanhuman

Predictions only

Length 464 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK8P49336 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CDK8P49336 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
CDK8P49336 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CDK8P49336 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CDK8P49336 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CDK8P49336 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CDK8P49336 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CDK8P49336 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CDK8P49336 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CDK8P49336 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CDK8P49336 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CDK8P49336 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CDK8P49336 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CDK8P49336 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CDK8P49336 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CDK8P49336 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CDK8P49336 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CDK8P49336 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CDK8P49336 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CDK8P49336 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
CDK8P49336 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
CDK8P49336 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CDK8P49336 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
CDK8P49336 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CDK8P49336 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CDK8P49336 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CDK8P49336 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CDK8P49336 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CDK8P49336 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CDK8P49336 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CDK8P49336 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CDK8P49336 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CDK8P49336 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CDK8P49336 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CDK8P49336 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CDK8P49336 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CDK8P49336 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CDK8P49336 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CDK8P49336 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CDK8P49336 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CDK8P49336 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CDK8P49336 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CDK8P49336 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CDK8P49336 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CDK8P49336 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CDK8P49336 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CDK8P49336 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CDK8P49336 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CDK8P49336 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CDK8P49336 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CDK8P49336 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CDK8P49336 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CDK8P49336 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
CDK8P49336 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
CDK8P49336 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
CDK8P49336 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CDK8P49336 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CDK8P49336 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CDK8P49336 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CDK8P49336 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CDK8P49336 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CDK8P49336 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CDK8P49336 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
CDK8P49336 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CDK8P49336 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
CDK8P49336 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CDK8P49336 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CDK8P49336 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CDK8P49336 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CDK8P49336 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CDK8P49336 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
CDK8P49336 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CDK8P49336 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CDK8P49336 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CDK8P49336 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CDK8P49336 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
CDK8P49336 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CDK8P49336 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CDK8P49336 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CDK8P49336 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CDK8P49336 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CDK8P49336 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CDK8P49336 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CDK8P49336 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CDK8P49336 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CDK8P49336 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CDK8P49336 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CDK8P49336 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CDK8P49336 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CDK8P49336 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CDK8P49336 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CDK8P49336 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CDK8P49336 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CDK8P49336 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CDK8P49336 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CDK8P49336 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
CDK8P49336 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CDK8P49336 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
CDK8P49336 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CDK8P49336 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22 ms