Protein–RNA interactions for Protein: P48169

GABRA4, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit alpha-4, humanhuman

Predictions only

Length 554 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABRA4P48169 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
GABRA4P48169 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
GABRA4P48169 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
GABRA4P48169 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
GABRA4P48169 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
GABRA4P48169 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
GABRA4P48169 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
GABRA4P48169 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
GABRA4P48169 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
GABRA4P48169 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
GABRA4P48169 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
GABRA4P48169 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
GABRA4P48169 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
GABRA4P48169 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
GABRA4P48169 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
GABRA4P48169 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
GABRA4P48169 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
GABRA4P48169 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
GABRA4P48169 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
GABRA4P48169 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
GABRA4P48169 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
GABRA4P48169 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
GABRA4P48169 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
GABRA4P48169 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
GABRA4P48169 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
GABRA4P48169 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
GABRA4P48169 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
GABRA4P48169 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
GABRA4P48169 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
GABRA4P48169 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
GABRA4P48169 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
GABRA4P48169 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
GABRA4P48169 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
GABRA4P48169 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
GABRA4P48169 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
GABRA4P48169 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
GABRA4P48169 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
GABRA4P48169 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
GABRA4P48169 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
GABRA4P48169 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
GABRA4P48169 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
GABRA4P48169 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
GABRA4P48169 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
GABRA4P48169 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
GABRA4P48169 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
GABRA4P48169 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
GABRA4P48169 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
GABRA4P48169 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
GABRA4P48169 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
GABRA4P48169 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
GABRA4P48169 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
GABRA4P48169 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
GABRA4P48169 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
GABRA4P48169 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
GABRA4P48169 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
GABRA4P48169 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
GABRA4P48169 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
GABRA4P48169 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
GABRA4P48169 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
GABRA4P48169 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
GABRA4P48169 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
GABRA4P48169 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
GABRA4P48169 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
GABRA4P48169 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
GABRA4P48169 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
GABRA4P48169 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
GABRA4P48169 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
GABRA4P48169 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
GABRA4P48169 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
GABRA4P48169 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
GABRA4P48169 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
GABRA4P48169 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
GABRA4P48169 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
GABRA4P48169 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
GABRA4P48169 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
GABRA4P48169 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
GABRA4P48169 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
GABRA4P48169 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
GABRA4P48169 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
GABRA4P48169 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
GABRA4P48169 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
GABRA4P48169 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
GABRA4P48169 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
GABRA4P48169 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
GABRA4P48169 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
GABRA4P48169 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
GABRA4P48169 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
GABRA4P48169 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
GABRA4P48169 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
GABRA4P48169 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
GABRA4P48169 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
GABRA4P48169 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
GABRA4P48169 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
GABRA4P48169 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
GABRA4P48169 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
GABRA4P48169 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
GABRA4P48169 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
GABRA4P48169 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
GABRA4P48169 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
GABRA4P48169 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.3 ms