Protein–RNA interactions for Protein: P48163

ME1, NADP-dependent malic enzyme, humanhuman

Predictions only

Length 572 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ME1P48163 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ME1P48163 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ME1P48163 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ME1P48163 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ME1P48163 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ME1P48163 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ME1P48163 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ME1P48163 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ME1P48163 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ME1P48163 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ME1P48163 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ME1P48163 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ME1P48163 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ME1P48163 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ME1P48163 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ME1P48163 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ME1P48163 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ME1P48163 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ME1P48163 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ME1P48163 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ME1P48163 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ME1P48163 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ME1P48163 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ME1P48163 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ME1P48163 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ME1P48163 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ME1P48163 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ME1P48163 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
ME1P48163 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ME1P48163 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ME1P48163 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ME1P48163 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ME1P48163 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ME1P48163 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ME1P48163 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ME1P48163 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ME1P48163 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ME1P48163 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ME1P48163 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ME1P48163 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ME1P48163 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
ME1P48163 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
ME1P48163 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ME1P48163 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ME1P48163 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ME1P48163 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ME1P48163 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ME1P48163 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ME1P48163 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ME1P48163 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ME1P48163 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ME1P48163 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ME1P48163 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ME1P48163 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ME1P48163 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
ME1P48163 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
ME1P48163 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
ME1P48163 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
ME1P48163 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
ME1P48163 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
ME1P48163 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
ME1P48163 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
ME1P48163 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
ME1P48163 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
ME1P48163 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
ME1P48163 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
ME1P48163 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
ME1P48163 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
ME1P48163 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
ME1P48163 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
ME1P48163 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
ME1P48163 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
ME1P48163 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
ME1P48163 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
ME1P48163 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
ME1P48163 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
ME1P48163 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
ME1P48163 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
ME1P48163 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
ME1P48163 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
ME1P48163 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC21.58■■□□□ 1.04
ME1P48163 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
ME1P48163 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
ME1P48163 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
ME1P48163 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
ME1P48163 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC21.58■■□□□ 1.04
ME1P48163 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.04
ME1P48163 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ME1P48163 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ME1P48163 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ME1P48163 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ME1P48163 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ME1P48163 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ME1P48163 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ME1P48163 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ME1P48163 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ME1P48163 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
ME1P48163 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ME1P48163 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ME1P48163 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.1 ms