Protein–RNA interactions for Protein: P48058

GRIA4, Glutamate receptor 4, humanhuman

Predictions only

Length 902 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIA4P48058 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
GRIA4P48058 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
GRIA4P48058 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
GRIA4P48058 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
GRIA4P48058 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC19.29■□□□□ 0.68
GRIA4P48058 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
GRIA4P48058 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
GRIA4P48058 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
GRIA4P48058 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
GRIA4P48058 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
GRIA4P48058 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
GRIA4P48058 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC19.29■□□□□ 0.68
GRIA4P48058 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
GRIA4P48058 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
GRIA4P48058 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
GRIA4P48058 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
GRIA4P48058 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
GRIA4P48058 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
GRIA4P48058 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
GRIA4P48058 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
GRIA4P48058 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
GRIA4P48058 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
GRIA4P48058 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
GRIA4P48058 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
GRIA4P48058 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
GRIA4P48058 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
GRIA4P48058 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
GRIA4P48058 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
GRIA4P48058 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
GRIA4P48058 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
GRIA4P48058 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
GRIA4P48058 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
GRIA4P48058 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
GRIA4P48058 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
GRIA4P48058 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
GRIA4P48058 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
GRIA4P48058 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
GRIA4P48058 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
GRIA4P48058 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
GRIA4P48058 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
GRIA4P48058 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
GRIA4P48058 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
GRIA4P48058 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
GRIA4P48058 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
GRIA4P48058 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
GRIA4P48058 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
GRIA4P48058 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
GRIA4P48058 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
GRIA4P48058 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
GRIA4P48058 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
GRIA4P48058 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
GRIA4P48058 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
GRIA4P48058 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
GRIA4P48058 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
GRIA4P48058 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
GRIA4P48058 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
GRIA4P48058 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
GRIA4P48058 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
GRIA4P48058 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
GRIA4P48058 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
GRIA4P48058 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
GRIA4P48058 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
GRIA4P48058 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
GRIA4P48058 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
GRIA4P48058 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC19.27■□□□□ 0.68
GRIA4P48058 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
GRIA4P48058 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
GRIA4P48058 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
GRIA4P48058 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
GRIA4P48058 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
GRIA4P48058 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
GRIA4P48058 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
GRIA4P48058 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
GRIA4P48058 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
GRIA4P48058 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
GRIA4P48058 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
GRIA4P48058 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
GRIA4P48058 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
GRIA4P48058 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.67
GRIA4P48058 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
GRIA4P48058 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.67
GRIA4P48058 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
GRIA4P48058 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
GRIA4P48058 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
GRIA4P48058 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.67
GRIA4P48058 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
GRIA4P48058 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
GRIA4P48058 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
GRIA4P48058 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
GRIA4P48058 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
GRIA4P48058 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
GRIA4P48058 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
GRIA4P48058 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
GRIA4P48058 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
GRIA4P48058 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
GRIA4P48058 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
GRIA4P48058 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
GRIA4P48058 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
GRIA4P48058 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
GRIA4P48058 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.9 ms