Protein–RNA interactions for Protein: P47869

GABRA2, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit alpha-2, humanhuman

Predictions only

Length 451 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABRA2P47869 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
GABRA2P47869 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
GABRA2P47869 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
GABRA2P47869 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
GABRA2P47869 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
GABRA2P47869 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
GABRA2P47869 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
GABRA2P47869 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
GABRA2P47869 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
GABRA2P47869 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
GABRA2P47869 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
GABRA2P47869 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
GABRA2P47869 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
GABRA2P47869 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
GABRA2P47869 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
GABRA2P47869 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
GABRA2P47869 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
GABRA2P47869 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
GABRA2P47869 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
GABRA2P47869 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
GABRA2P47869 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
GABRA2P47869 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
GABRA2P47869 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GABRA2P47869 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GABRA2P47869 FAM208A-209ENST00000493960 5600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GABRA2P47869 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GABRA2P47869 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GABRA2P47869 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GABRA2P47869 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
GABRA2P47869 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GABRA2P47869 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GABRA2P47869 MALT1-202ENST00000348428 9368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GABRA2P47869 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GABRA2P47869 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GABRA2P47869 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GABRA2P47869 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GABRA2P47869 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
GABRA2P47869 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GABRA2P47869 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GABRA2P47869 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GABRA2P47869 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
GABRA2P47869 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GABRA2P47869 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GABRA2P47869 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GABRA2P47869 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GABRA2P47869 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GABRA2P47869 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GABRA2P47869 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GABRA2P47869 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GABRA2P47869 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GABRA2P47869 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GABRA2P47869 ADGRB2-202ENST00000373658 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GABRA2P47869 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GABRA2P47869 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GABRA2P47869 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GABRA2P47869 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GABRA2P47869 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GABRA2P47869 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GABRA2P47869 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
GABRA2P47869 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GABRA2P47869 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GABRA2P47869 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GABRA2P47869 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GABRA2P47869 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GABRA2P47869 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GABRA2P47869 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GABRA2P47869 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
GABRA2P47869 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GABRA2P47869 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GABRA2P47869 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
GABRA2P47869 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
GABRA2P47869 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
GABRA2P47869 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
GABRA2P47869 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
GABRA2P47869 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GABRA2P47869 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC16■□□□□ 0.15
GABRA2P47869 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC16■□□□□ 0.15
GABRA2P47869 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
GABRA2P47869 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
GABRA2P47869 BACE1-201ENST00000313005 6326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GABRA2P47869 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GABRA2P47869 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
GABRA2P47869 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
GABRA2P47869 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC16■□□□□ 0.15
GABRA2P47869 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GABRA2P47869 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GABRA2P47869 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GABRA2P47869 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GABRA2P47869 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
GABRA2P47869 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
GABRA2P47869 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GABRA2P47869 LENG8-202ENST00000376514 5146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
GABRA2P47869 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GABRA2P47869 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GABRA2P47869 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GABRA2P47869 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GABRA2P47869 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GABRA2P47869 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GABRA2P47869 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GABRA2P47869 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.8 ms