Protein–RNA interactions for Protein: P46100

ATRX, Transcriptional regulator ATRX, humanhuman

Predictions only

Length 2,492 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATRXP46100 AL049840.3-201ENST00000602669 611 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
ATRXP46100 MCCC2-209ENST00000629193 1128 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ATRXP46100 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ATRXP46100 C8orf76-201ENST00000276704 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ATRXP46100 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ATRXP46100 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
ATRXP46100 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ATRXP46100 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ATRXP46100 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ATRXP46100 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ATRXP46100 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ATRXP46100 SIGLEC30P-201ENST00000455569 941 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
ATRXP46100 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ATRXP46100 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ATRXP46100 AC087641.1-201ENST00000557561 1021 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
ATRXP46100 CCL3-204ENST00000613922 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ATRXP46100 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ATRXP46100 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ATRXP46100 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ATRXP46100 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ATRXP46100 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ATRXP46100 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ATRXP46100 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ATRXP46100 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ATRXP46100 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ATRXP46100 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ATRXP46100 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ATRXP46100 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ATRXP46100 ANXA4-202ENST00000409920 1414 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ATRXP46100 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
ATRXP46100 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
ATRXP46100 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.34
ATRXP46100 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
ATRXP46100 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
ATRXP46100 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
ATRXP46100 IQCF3-204ENST00000446775 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
ATRXP46100 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
ATRXP46100 AC040169.1-201ENST00000565382 521 ntBASIC17.21■□□□□ 0.34
ATRXP46100 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.34
ATRXP46100 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ATRXP46100 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ATRXP46100 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ATRXP46100 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ATRXP46100 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ATRXP46100 SYCE1-203ENST00000368517 1377 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ATRXP46100 BAX-203ENST00000354470 433 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ATRXP46100 BAX-206ENST00000415969 540 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ATRXP46100 AP000688.1-201ENST00000535199 1221 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ATRXP46100 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ATRXP46100 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ATRXP46100 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ATRXP46100 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
ATRXP46100 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
ATRXP46100 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ATRXP46100 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ATRXP46100 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ATRXP46100 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ATRXP46100 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ATRXP46100 GSTO1-207ENST00000539281 1052 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ATRXP46100 ZNF773-202ENST00000593916 548 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ATRXP46100 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ATRXP46100 PSMA6-216ENST00000627895 484 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ATRXP46100 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
ATRXP46100 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ATRXP46100 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
ATRXP46100 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ATRXP46100 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ATRXP46100 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ATRXP46100 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ATRXP46100 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ATRXP46100 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ATRXP46100 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ATRXP46100 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ATRXP46100 PAXX-201ENST00000371620 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ATRXP46100 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ATRXP46100 TXNRD2-212ENST00000485358 850 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ATRXP46100 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ATRXP46100 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ATRXP46100 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
ATRXP46100 MTDHP5-201ENST00000598980 586 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
ATRXP46100 ANO2-212ENST00000612575 1087 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ATRXP46100 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ATRXP46100 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ATRXP46100 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ATRXP46100 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ATRXP46100 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ATRXP46100 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ATRXP46100 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ATRXP46100 FAM221A-202ENST00000409192 888 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ATRXP46100 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ATRXP46100 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ATRXP46100 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ATRXP46100 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ATRXP46100 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ATRXP46100 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ATRXP46100 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ATRXP46100 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ATRXP46100 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ATRXP46100 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ATRXP46100 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.7 ms