Protein–RNA interactions for Protein: P42766

RPL35, 60S ribosomal protein L35, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 123 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPL35P42766 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
RPL35P42766 CYP4F11-203ENST00000402119 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
RPL35P42766 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
RPL35P42766 RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 4931 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
RPL35P42766 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
RPL35P42766 ZBTB46-201ENST00000245663 5185 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
RPL35P42766 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
RPL35P42766 MYEF2-215ENST00000610570 2591 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
RPL35P42766 PNMA6E-202ENST00000633844 2596 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.02
RPL35P42766 PCDHA1-203ENST00000504120 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
RPL35P42766 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC15.21■□□□□ 0.02
RPL35P42766 DGKZ-201ENST00000318201 3213 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
RPL35P42766 APBA2-207ENST00000558402 4031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
RPL35P42766 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RPL35P42766 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RPL35P42766 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RPL35P42766 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RPL35P42766 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RPL35P42766 MAP6-202ENST00000434603 4329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RPL35P42766 ZNF500-201ENST00000219478 5880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RPL35P42766 TBC1D10B-201ENST00000409939 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RPL35P42766 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RPL35P42766 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RPL35P42766 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RPL35P42766 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RPL35P42766 NKILA-202ENST00000614771 2598 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
RPL35P42766 ADRA2A-201ENST00000280155 3745 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RPL35P42766 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RPL35P42766 CELF6-201ENST00000287202 3345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RPL35P42766 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RPL35P42766 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RPL35P42766 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RPL35P42766 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RPL35P42766 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RPL35P42766 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RPL35P42766 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RPL35P42766 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RPL35P42766 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RPL35P42766 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RPL35P42766 PIAS3-201ENST00000369298 2761 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RPL35P42766 AK5-203ENST00000354567 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RPL35P42766 FBXO21-208ENST00000622495 6040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RPL35P42766 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RPL35P42766 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
RPL35P42766 AFAP1L2-202ENST00000369271 3964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RPL35P42766 CAMTA1-201ENST00000303635 8444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RPL35P42766 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RPL35P42766 S1PR2-201ENST00000590320 3582 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RPL35P42766 TDRD6-203ENST00000544460 8887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RPL35P42766 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RPL35P42766 COL5A1-201ENST00000371817 8471 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RPL35P42766 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RPL35P42766 ARHGEF28-211ENST00000512883 2936 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RPL35P42766 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RPL35P42766 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RPL35P42766 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RPL35P42766 UBR5-207ENST00000520539 10297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RPL35P42766 ZNF619-205ENST00000456778 2192 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RPL35P42766 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RPL35P42766 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RPL35P42766 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RPL35P42766 PRKAR2B-201ENST00000265717 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RPL35P42766 CD34-202ENST00000356522 2874 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RPL35P42766 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
RPL35P42766 TMEM132E-201ENST00000321639 5631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RPL35P42766 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RPL35P42766 RBFOX1-212ENST00000550418 4775 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RPL35P42766 TFR2-202ENST00000431692 2631 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RPL35P42766 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RPL35P42766 GCLM-201ENST00000370238 4857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RPL35P42766 DACT3-203ENST00000410105 3085 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RPL35P42766 GNG2-213ENST00000556766 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RPL35P42766 SLCO5A1-201ENST00000260126 9076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RPL35P42766 MX1-210ENST00000455164 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RPL35P42766 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RPL35P42766 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RPL35P42766 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RPL35P42766 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RPL35P42766 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
RPL35P42766 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RPL35P42766 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RPL35P42766 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RPL35P42766 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RPL35P42766 SMC4-204ENST00000462787 5033 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RPL35P42766 PAK6-202ENST00000455577 4215 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RPL35P42766 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
RPL35P42766 TCF25-202ENST00000263347 2377 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RPL35P42766 GPR176-205ENST00000561100 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RPL35P42766 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RPL35P42766 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
RPL35P42766 IGFBP3-203ENST00000381086 2322 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RPL35P42766 JRK-210ENST00000614134 8932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RPL35P42766 ZNF767P-201ENST00000463567 3520 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RPL35P42766 SYT5-207ENST00000590851 3619 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RPL35P42766 CES3-203ENST00000543856 3178 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RPL35P42766 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RPL35P42766 MAPK8IP2-202ENST00000329492 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RPL35P42766 PHKG2-204ENST00000563588 5539 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RPL35P42766 ZNF84-208ENST00000539354 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RPL35P42766 DUOX1-202ENST00000389037 5483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27 ms