Protein–RNA interactions for Protein: P40198

CEACAM3, Carcinoembryonic antigen-related cell adhesion molecule 3, humanhuman

Predictions only

Length 252 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEACAM3P40198 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CEACAM3P40198 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CEACAM3P40198 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CEACAM3P40198 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CEACAM3P40198 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CEACAM3P40198 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CEACAM3P40198 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CEACAM3P40198 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CEACAM3P40198 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CEACAM3P40198 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CEACAM3P40198 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CEACAM3P40198 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CEACAM3P40198 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CEACAM3P40198 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CEACAM3P40198 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CEACAM3P40198 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CEACAM3P40198 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CEACAM3P40198 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
CEACAM3P40198 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CEACAM3P40198 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CEACAM3P40198 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CEACAM3P40198 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CEACAM3P40198 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CEACAM3P40198 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CEACAM3P40198 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CEACAM3P40198 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CEACAM3P40198 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CEACAM3P40198 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CEACAM3P40198 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CEACAM3P40198 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CEACAM3P40198 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CEACAM3P40198 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CEACAM3P40198 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CEACAM3P40198 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CEACAM3P40198 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CEACAM3P40198 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CEACAM3P40198 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CEACAM3P40198 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CEACAM3P40198 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CEACAM3P40198 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CEACAM3P40198 HEG1-201ENST00000311127 9156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CEACAM3P40198 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CEACAM3P40198 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CEACAM3P40198 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CEACAM3P40198 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CEACAM3P40198 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CEACAM3P40198 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CEACAM3P40198 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CEACAM3P40198 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CEACAM3P40198 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CEACAM3P40198 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CEACAM3P40198 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CEACAM3P40198 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
CEACAM3P40198 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CEACAM3P40198 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CEACAM3P40198 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CEACAM3P40198 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CEACAM3P40198 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CEACAM3P40198 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
CEACAM3P40198 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CEACAM3P40198 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CEACAM3P40198 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CEACAM3P40198 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CEACAM3P40198 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CEACAM3P40198 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CEACAM3P40198 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CEACAM3P40198 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CEACAM3P40198 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CEACAM3P40198 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CEACAM3P40198 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CEACAM3P40198 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
CEACAM3P40198 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CEACAM3P40198 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CEACAM3P40198 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CEACAM3P40198 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CEACAM3P40198 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CEACAM3P40198 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CEACAM3P40198 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CEACAM3P40198 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CEACAM3P40198 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CEACAM3P40198 WIZ-201ENST00000263381 5695 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CEACAM3P40198 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CEACAM3P40198 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CEACAM3P40198 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CEACAM3P40198 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CEACAM3P40198 UNC13A-206ENST00000552293 5314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CEACAM3P40198 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CEACAM3P40198 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CEACAM3P40198 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CEACAM3P40198 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CEACAM3P40198 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CEACAM3P40198 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CEACAM3P40198 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CEACAM3P40198 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CEACAM3P40198 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CEACAM3P40198 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CEACAM3P40198 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CEACAM3P40198 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CEACAM3P40198 ADGRB2-202ENST00000373658 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CEACAM3P40198 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.5 ms